Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxa5P09021 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxa5P09021 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxa5P09021 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxa5P09021 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxa5P09021 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxa5P09021 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxa5P09021 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxa5P09021 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxa5P09021 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxa5P09021 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxa5P09021 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxa5P09021 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxa5P09021 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxa5P09021 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxa5P09021 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxa5P09021 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxa5P09021 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxa5P09021 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxa5P09021 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxa5P09021 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Hoxa5P09021 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Hoxa5P09021 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxa5P09021 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxa5P09021 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxa5P09021 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxa5P09021 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxa5P09021 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxa5P09021 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxa5P09021 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxa5P09021 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxa5P09021 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxa5P09021 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxa5P09021 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxa5P09021 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxa5P09021 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxa5P09021 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxa5P09021 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxa5P09021 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxa5P09021 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxa5P09021 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxa5P09021 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxa5P09021 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxa5P09021 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxa5P09021 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxa5P09021 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxa5P09021 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxa5P09021 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxa5P09021 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxa5P09021 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxa5P09021 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxa5P09021 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxa5P09021 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxa5P09021 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxa5P09021 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxa5P09021 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Hoxa5P09021 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxa5P09021 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxa5P09021 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxa5P09021 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Hoxa5P09021 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxa5P09021 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxa5P09021 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxa5P09021 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxa5P09021 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxa5P09021 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxa5P09021 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxa5P09021 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxa5P09021 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxa5P09021 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxa5P09021 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxa5P09021 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxa5P09021 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxa5P09021 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxa5P09021 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxa5P09021 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxa5P09021 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxa5P09021 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxa5P09021 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxa5P09021 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxa5P09021 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxa5P09021 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxa5P09021 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxa5P09021 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxa5P09021 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxa5P09021 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxa5P09021 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxa5P09021 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxa5P09021 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxa5P09021 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxa5P09021 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxa5P09021 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxa5P09021 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxa5P09021 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxa5P09021 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxa5P09021 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxa5P09021 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxa5P09021 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxa5P09021 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxa5P09021 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms