Protein–RNA interactions for Protein: P08884

Gzme, Granzyme E, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GzmeP08884 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GzmeP08884 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GzmeP08884 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GzmeP08884 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GzmeP08884 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GzmeP08884 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GzmeP08884 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GzmeP08884 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GzmeP08884 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GzmeP08884 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GzmeP08884 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GzmeP08884 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GzmeP08884 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GzmeP08884 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GzmeP08884 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GzmeP08884 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GzmeP08884 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GzmeP08884 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GzmeP08884 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GzmeP08884 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GzmeP08884 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GzmeP08884 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GzmeP08884 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GzmeP08884 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GzmeP08884 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GzmeP08884 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GzmeP08884 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GzmeP08884 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GzmeP08884 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GzmeP08884 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GzmeP08884 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GzmeP08884 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GzmeP08884 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GzmeP08884 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GzmeP08884 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GzmeP08884 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GzmeP08884 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GzmeP08884 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GzmeP08884 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GzmeP08884 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GzmeP08884 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GzmeP08884 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GzmeP08884 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GzmeP08884 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GzmeP08884 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GzmeP08884 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GzmeP08884 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GzmeP08884 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GzmeP08884 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GzmeP08884 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GzmeP08884 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GzmeP08884 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GzmeP08884 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GzmeP08884 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GzmeP08884 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GzmeP08884 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GzmeP08884 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GzmeP08884 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GzmeP08884 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GzmeP08884 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GzmeP08884 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GzmeP08884 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GzmeP08884 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GzmeP08884 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GzmeP08884 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GzmeP08884 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GzmeP08884 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GzmeP08884 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GzmeP08884 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GzmeP08884 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GzmeP08884 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GzmeP08884 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GzmeP08884 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GzmeP08884 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GzmeP08884 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GzmeP08884 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GzmeP08884 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GzmeP08884 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GzmeP08884 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GzmeP08884 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GzmeP08884 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GzmeP08884 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GzmeP08884 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GzmeP08884 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GzmeP08884 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GzmeP08884 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GzmeP08884 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GzmeP08884 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GzmeP08884 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GzmeP08884 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GzmeP08884 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GzmeP08884 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GzmeP08884 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GzmeP08884 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GzmeP08884 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GzmeP08884 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GzmeP08884 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GzmeP08884 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GzmeP08884 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GzmeP08884 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms