Protein–RNA interactions for Protein: P08152

Egr2, E3 SUMO-protein ligase EGR2, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr2P08152 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Egr2P08152 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Egr2P08152 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Egr2P08152 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Egr2P08152 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Egr2P08152 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Egr2P08152 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Egr2P08152 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Egr2P08152 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Egr2P08152 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Egr2P08152 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Egr2P08152 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Egr2P08152 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Egr2P08152 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Egr2P08152 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Egr2P08152 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Egr2P08152 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Egr2P08152 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Egr2P08152 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Egr2P08152 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Egr2P08152 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Egr2P08152 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Egr2P08152 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Egr2P08152 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Egr2P08152 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Egr2P08152 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Egr2P08152 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Egr2P08152 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Egr2P08152 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Egr2P08152 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Egr2P08152 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Egr2P08152 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Egr2P08152 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Egr2P08152 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Egr2P08152 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Egr2P08152 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Egr2P08152 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Egr2P08152 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Egr2P08152 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Egr2P08152 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Egr2P08152 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Egr2P08152 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Egr2P08152 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Egr2P08152 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Egr2P08152 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Egr2P08152 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Egr2P08152 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Egr2P08152 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Egr2P08152 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Egr2P08152 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Egr2P08152 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Egr2P08152 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Egr2P08152 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Egr2P08152 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Egr2P08152 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Egr2P08152 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Egr2P08152 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Egr2P08152 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Egr2P08152 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Egr2P08152 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Egr2P08152 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Egr2P08152 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Egr2P08152 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Egr2P08152 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Egr2P08152 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Egr2P08152 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Egr2P08152 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Egr2P08152 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Egr2P08152 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Egr2P08152 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Egr2P08152 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Egr2P08152 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Egr2P08152 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Egr2P08152 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Egr2P08152 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Egr2P08152 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Egr2P08152 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Egr2P08152 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Egr2P08152 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Egr2P08152 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Egr2P08152 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Egr2P08152 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Egr2P08152 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Egr2P08152 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Egr2P08152 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Egr2P08152 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Egr2P08152 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Egr2P08152 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Egr2P08152 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Egr2P08152 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Egr2P08152 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Egr2P08152 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Egr2P08152 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Egr2P08152 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Egr2P08152 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Egr2P08152 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Egr2P08152 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Egr2P08152 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Egr2P08152 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Egr2P08152 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms