Protein–RNA interactions for Protein: P07141

Csf1, Macrophage colony-stimulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf1P07141 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Csf1P07141 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Csf1P07141 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Csf1P07141 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Csf1P07141 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Csf1P07141 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Csf1P07141 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Csf1P07141 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Csf1P07141 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Csf1P07141 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Csf1P07141 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Csf1P07141 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Csf1P07141 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Csf1P07141 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Csf1P07141 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Csf1P07141 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Csf1P07141 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Csf1P07141 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Csf1P07141 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Csf1P07141 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Csf1P07141 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Csf1P07141 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Csf1P07141 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Csf1P07141 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Csf1P07141 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Csf1P07141 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Csf1P07141 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Csf1P07141 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Csf1P07141 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Csf1P07141 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Csf1P07141 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Csf1P07141 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Csf1P07141 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Csf1P07141 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Csf1P07141 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Csf1P07141 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Csf1P07141 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Csf1P07141 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Csf1P07141 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Csf1P07141 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Csf1P07141 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Csf1P07141 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Csf1P07141 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Csf1P07141 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Csf1P07141 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Csf1P07141 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Csf1P07141 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Csf1P07141 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Csf1P07141 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Csf1P07141 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Csf1P07141 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Csf1P07141 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csf1P07141 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csf1P07141 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Csf1P07141 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csf1P07141 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csf1P07141 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csf1P07141 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csf1P07141 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csf1P07141 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csf1P07141 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csf1P07141 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csf1P07141 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csf1P07141 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csf1P07141 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csf1P07141 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csf1P07141 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Csf1P07141 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Csf1P07141 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Csf1P07141 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Csf1P07141 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csf1P07141 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csf1P07141 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csf1P07141 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csf1P07141 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csf1P07141 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csf1P07141 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Csf1P07141 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Csf1P07141 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csf1P07141 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csf1P07141 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csf1P07141 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csf1P07141 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csf1P07141 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Csf1P07141 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Csf1P07141 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Csf1P07141 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csf1P07141 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Csf1P07141 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Csf1P07141 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Csf1P07141 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csf1P07141 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csf1P07141 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Csf1P07141 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Csf1P07141 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Csf1P07141 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Csf1P07141 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Csf1P07141 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Csf1P07141 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Csf1P07141 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms