Protein–RNA interactions for Protein: P06880

Gh1, Somatotropin, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gh1P06880 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gh1P06880 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gh1P06880 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gh1P06880 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gh1P06880 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gh1P06880 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gh1P06880 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gh1P06880 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Gh1P06880 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gh1P06880 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gh1P06880 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gh1P06880 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gh1P06880 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gh1P06880 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gh1P06880 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gh1P06880 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gh1P06880 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gh1P06880 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gh1P06880 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gh1P06880 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gh1P06880 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gh1P06880 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gh1P06880 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gh1P06880 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gh1P06880 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gh1P06880 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gh1P06880 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gh1P06880 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gh1P06880 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gh1P06880 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gh1P06880 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gh1P06880 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gh1P06880 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gh1P06880 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gh1P06880 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gh1P06880 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gh1P06880 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gh1P06880 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gh1P06880 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gh1P06880 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Gh1P06880 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gh1P06880 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gh1P06880 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gh1P06880 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gh1P06880 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gh1P06880 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gh1P06880 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gh1P06880 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gh1P06880 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gh1P06880 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gh1P06880 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gh1P06880 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Gh1P06880 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gh1P06880 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gh1P06880 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gh1P06880 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gh1P06880 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gh1P06880 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gh1P06880 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gh1P06880 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gh1P06880 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gh1P06880 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gh1P06880 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gh1P06880 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gh1P06880 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gh1P06880 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Gh1P06880 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Gh1P06880 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gh1P06880 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gh1P06880 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gh1P06880 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gh1P06880 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Gh1P06880 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gh1P06880 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gh1P06880 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gh1P06880 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gh1P06880 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gh1P06880 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gh1P06880 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gh1P06880 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gh1P06880 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gh1P06880 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gh1P06880 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gh1P06880 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gh1P06880 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gh1P06880 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gh1P06880 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gh1P06880 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gh1P06880 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Gh1P06880 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gh1P06880 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gh1P06880 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gh1P06880 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gh1P06880 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gh1P06880 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gh1P06880 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gh1P06880 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gh1P06880 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Gh1P06880 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gh1P06880 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 290.4 ms