Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
H2-Eb1P04230 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
H2-Eb1P04230 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
H2-Eb1P04230 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
H2-Eb1P04230 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
H2-Eb1P04230 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
H2-Eb1P04230 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
H2-Eb1P04230 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
H2-Eb1P04230 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
H2-Eb1P04230 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
H2-Eb1P04230 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
H2-Eb1P04230 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
H2-Eb1P04230 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
H2-Eb1P04230 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
H2-Eb1P04230 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
H2-Eb1P04230 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
H2-Eb1P04230 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
H2-Eb1P04230 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
H2-Eb1P04230 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
H2-Eb1P04230 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
H2-Eb1P04230 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
H2-Eb1P04230 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
H2-Eb1P04230 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
H2-Eb1P04230 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
H2-Eb1P04230 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
H2-Eb1P04230 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
H2-Eb1P04230 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
H2-Eb1P04230 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
H2-Eb1P04230 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
H2-Eb1P04230 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
H2-Eb1P04230 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
H2-Eb1P04230 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
H2-Eb1P04230 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
H2-Eb1P04230 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
H2-Eb1P04230 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
H2-Eb1P04230 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
H2-Eb1P04230 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
H2-Eb1P04230 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
H2-Eb1P04230 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
H2-Eb1P04230 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
H2-Eb1P04230 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
H2-Eb1P04230 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H2-Eb1P04230 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H2-Eb1P04230 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
H2-Eb1P04230 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
H2-Eb1P04230 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
H2-Eb1P04230 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
H2-Eb1P04230 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
H2-Eb1P04230 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
H2-Eb1P04230 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
H2-Eb1P04230 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
H2-Eb1P04230 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
H2-Eb1P04230 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H2-Eb1P04230 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H2-Eb1P04230 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H2-Eb1P04230 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
H2-Eb1P04230 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
H2-Eb1P04230 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
H2-Eb1P04230 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
H2-Eb1P04230 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
H2-Eb1P04230 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
H2-Eb1P04230 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
H2-Eb1P04230 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
H2-Eb1P04230 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
H2-Eb1P04230 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
H2-Eb1P04230 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
H2-Eb1P04230 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
H2-Eb1P04230 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
H2-Eb1P04230 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
H2-Eb1P04230 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
H2-Eb1P04230 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
H2-Eb1P04230 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
H2-Eb1P04230 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
H2-Eb1P04230 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
H2-Eb1P04230 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
H2-Eb1P04230 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
H2-Eb1P04230 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
H2-Eb1P04230 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
H2-Eb1P04230 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
H2-Eb1P04230 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H2-Eb1P04230 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
H2-Eb1P04230 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H2-Eb1P04230 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H2-Eb1P04230 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
H2-Eb1P04230 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
H2-Eb1P04230 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H2-Eb1P04230 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
H2-Eb1P04230 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
H2-Eb1P04230 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H2-Eb1P04230 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H2-Eb1P04230 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H2-Eb1P04230 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
H2-Eb1P04230 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
H2-Eb1P04230 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H2-Eb1P04230 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H2-Eb1P04230 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H2-Eb1P04230 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H2-Eb1P04230 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H2-Eb1P04230 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
H2-Eb1P04230 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms