Protein–RNA interactions for Protein: P03987

Ig gamma-3 chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P03987 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
P03987 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P03987 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P03987 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P03987 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P03987 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
P03987 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P03987 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
P03987 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P03987 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
P03987 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
P03987 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
P03987 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
P03987 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
P03987 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
P03987 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
P03987 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
P03987 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
P03987 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
P03987 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
P03987 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
P03987 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
P03987 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
P03987 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
P03987 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
P03987 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P03987 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P03987 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P03987 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
P03987 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
P03987 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
P03987 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
P03987 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
P03987 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
P03987 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
P03987 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
P03987 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P03987 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
P03987 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
P03987 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
P03987 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
P03987 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
P03987 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P03987 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P03987 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
P03987 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P03987 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
P03987 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
P03987 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P03987 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
P03987 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
P03987 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
P03987 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
P03987 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
P03987 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
P03987 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
P03987 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
P03987 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
P03987 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
P03987 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
P03987 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
P03987 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
P03987 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
P03987 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
P03987 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
P03987 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
P03987 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P03987 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
P03987 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
P03987 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
P03987 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
P03987 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
P03987 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
P03987 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
P03987 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
P03987 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
P03987 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
P03987 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
P03987 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
P03987 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
P03987 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
P03987 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
P03987 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
P03987 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
P03987 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
P03987 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
P03987 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
P03987 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
P03987 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
P03987 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
P03987 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
P03987 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
P03987 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P03987 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P03987 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
P03987 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
P03987 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P03987 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P03987 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P03987 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms