Protein–RNA interactions for Protein: P01852

T-cell receptor beta-1 chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01852 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
P01852 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
P01852 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
P01852 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
P01852 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
P01852 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
P01852 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
P01852 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
P01852 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
P01852 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
P01852 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
P01852 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
P01852 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
P01852 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
P01852 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
P01852 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
P01852 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
P01852 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
P01852 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P01852 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
P01852 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
P01852 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
P01852 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
P01852 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
P01852 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
P01852 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
P01852 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
P01852 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
P01852 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
P01852 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
P01852 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
P01852 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
P01852 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
P01852 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
P01852 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
P01852 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
P01852 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
P01852 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
P01852 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
P01852 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
P01852 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
P01852 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
P01852 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
P01852 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
P01852 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
P01852 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
P01852 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
P01852 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
P01852 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
P01852 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
P01852 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
P01852 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
P01852 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
P01852 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
P01852 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
P01852 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
P01852 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
P01852 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
P01852 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01852 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01852 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01852 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01852 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01852 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
P01852 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
P01852 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
P01852 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
P01852 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
P01852 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
P01852 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
P01852 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
P01852 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
P01852 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
P01852 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
P01852 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
P01852 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
P01852 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P01852 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
P01852 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
P01852 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
P01852 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
P01852 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01852 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01852 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01852 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01852 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01852 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
P01852 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
P01852 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
P01852 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
P01852 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
P01852 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
P01852 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
P01852 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P01852 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P01852 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P01852 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
P01852 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P01852 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
P01852 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms