Protein–RNA interactions for Protein: P01101

Fos, Proto-oncogene c-Fos, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FosP01101 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
FosP01101 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28,3■■■□□ 2,12
FosP01101 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
FosP01101 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
FosP01101 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28,29■■■□□ 2,12
FosP01101 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,29■■■□□ 2,12
FosP01101 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
FosP01101 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,28■■■□□ 2,12
FosP01101 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
FosP01101 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
FosP01101 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
FosP01101 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
FosP01101 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
FosP01101 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28,25■■■□□ 2,11
FosP01101 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28,24■■■□□ 2,11
FosP01101 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
FosP01101 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
FosP01101 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
FosP01101 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28,2■■■□□ 2,1
FosP01101 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28,19■■■□□ 2,1
FosP01101 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
FosP01101 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
FosP01101 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
FosP01101 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
FosP01101 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28,16■■■□□ 2,1
FosP01101 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
FosP01101 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
FosP01101 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28,15■■■□□ 2,1
FosP01101 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
FosP01101 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
FosP01101 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
FosP01101 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
FosP01101 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
FosP01101 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
FosP01101 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
FosP01101 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
FosP01101 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
FosP01101 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
FosP01101 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28,12■■■□□ 2,09
FosP01101 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
FosP01101 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
FosP01101 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
FosP01101 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
FosP01101 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28,07■■■□□ 2,08
FosP01101 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
FosP01101 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
FosP01101 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
FosP01101 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,03■■■□□ 2,08
FosP01101 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
FosP01101 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,03■■■□□ 2,08
FosP01101 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
FosP01101 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
FosP01101 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
FosP01101 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2,07
FosP01101 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27,99■■■□□ 2,07
FosP01101 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
FosP01101 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
FosP01101 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27,97■■■□□ 2,07
FosP01101 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27,97■■■□□ 2,07
FosP01101 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
FosP01101 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27,96■■■□□ 2,07
FosP01101 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
FosP01101 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
FosP01101 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,94■■■□□ 2,06
FosP01101 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
FosP01101 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
FosP01101 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
FosP01101 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
FosP01101 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,05
FosP01101 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27,87■■■□□ 2,05
FosP01101 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27,87■■■□□ 2,05
FosP01101 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
FosP01101 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,86■■■□□ 2,05
FosP01101 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
FosP01101 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27,85■■■□□ 2,05
FosP01101 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,85■■■□□ 2,05
FosP01101 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
FosP01101 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
FosP01101 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
FosP01101 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
FosP01101 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27,82■■■□□ 2,04
FosP01101 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
FosP01101 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
FosP01101 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
FosP01101 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27,79■■■□□ 2,04
FosP01101 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
FosP01101 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
FosP01101 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27,78■■■□□ 2,04
FosP01101 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
FosP01101 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
FosP01101 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
FosP01101 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
FosP01101 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27,75■■■□□ 2,03
FosP01101 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
FosP01101 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
FosP01101 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
FosP01101 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27,7■■■□□ 2,02
FosP01101 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
FosP01101 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
FosP01101 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,68■■■□□ 2,02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms