Protein–RNA interactions for Protein: O89116

Vti1a, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1aO89116 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26,77■■□□□ 1,88
Vti1aO89116 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Vti1aO89116 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,76■■□□□ 1,87
Vti1aO89116 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Vti1aO89116 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Vti1aO89116 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26,74■■□□□ 1,87
Vti1aO89116 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26,74■■□□□ 1,87
Vti1aO89116 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Vti1aO89116 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26,73■■□□□ 1,87
Vti1aO89116 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26,72■■□□□ 1,87
Vti1aO89116 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,72■■□□□ 1,87
Vti1aO89116 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Vti1aO89116 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26,71■■□□□ 1,87
Vti1aO89116 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,86
Vti1aO89116 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,86
Vti1aO89116 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Vti1aO89116 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Vti1aO89116 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Vti1aO89116 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Vti1aO89116 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
Vti1aO89116 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26,67■■□□□ 1,86
Vti1aO89116 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Vti1aO89116 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Vti1aO89116 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,66■■□□□ 1,86
Vti1aO89116 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Vti1aO89116 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Vti1aO89116 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Vti1aO89116 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Vti1aO89116 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,86
Vti1aO89116 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Vti1aO89116 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26,62■■□□□ 1,85
Vti1aO89116 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Vti1aO89116 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26,61■■□□□ 1,85
Vti1aO89116 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
Vti1aO89116 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Vti1aO89116 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
Vti1aO89116 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Vti1aO89116 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Vti1aO89116 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Vti1aO89116 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26,55■■□□□ 1,84
Vti1aO89116 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26,55■■□□□ 1,84
Vti1aO89116 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,54■■□□□ 1,84
Vti1aO89116 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Vti1aO89116 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Vti1aO89116 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26,53■■□□□ 1,84
Vti1aO89116 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,52■■□□□ 1,84
Vti1aO89116 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
Vti1aO89116 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,51■■□□□ 1,83
Vti1aO89116 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Vti1aO89116 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Vti1aO89116 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26,5■■□□□ 1,83
Vti1aO89116 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Vti1aO89116 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Vti1aO89116 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Vti1aO89116 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Vti1aO89116 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Vti1aO89116 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,48■■□□□ 1,83
Vti1aO89116 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
Vti1aO89116 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
Vti1aO89116 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
Vti1aO89116 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
Vti1aO89116 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,45■■□□□ 1,83
Vti1aO89116 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,45■■□□□ 1,82
Vti1aO89116 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
Vti1aO89116 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26,44■■□□□ 1,82
Vti1aO89116 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Vti1aO89116 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,43■■□□□ 1,82
Vti1aO89116 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26,43■■□□□ 1,82
Vti1aO89116 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26,42■■□□□ 1,82
Vti1aO89116 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26,42■■□□□ 1,82
Vti1aO89116 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26,42■■□□□ 1,82
Vti1aO89116 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Vti1aO89116 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26,39■■□□□ 1,82
Vti1aO89116 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,82
Vti1aO89116 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26,39■■□□□ 1,81
Vti1aO89116 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,38■■□□□ 1,81
Vti1aO89116 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,37■■□□□ 1,81
Vti1aO89116 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26,37■■□□□ 1,81
Vti1aO89116 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26,37■■□□□ 1,81
Vti1aO89116 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26,37■■□□□ 1,81
Vti1aO89116 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26,36■■□□□ 1,81
Vti1aO89116 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,36■■□□□ 1,81
Vti1aO89116 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
Vti1aO89116 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
Vti1aO89116 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
Vti1aO89116 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
Vti1aO89116 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,35■■□□□ 1,81
Vti1aO89116 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Vti1aO89116 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26,34■■□□□ 1,81
Vti1aO89116 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,81
Vti1aO89116 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,8
Vti1aO89116 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,31■■□□□ 1,8
Vti1aO89116 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Vti1aO89116 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Vti1aO89116 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26,29■■□□□ 1,8
Vti1aO89116 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
Vti1aO89116 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
Vti1aO89116 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
Vti1aO89116 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
Vti1aO89116 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,6 ms