Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Casp8O89110 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Casp8O89110 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Casp8O89110 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Casp8O89110 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Casp8O89110 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Casp8O89110 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Casp8O89110 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Casp8O89110 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Casp8O89110 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Casp8O89110 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Casp8O89110 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Casp8O89110 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Casp8O89110 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Casp8O89110 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Casp8O89110 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Casp8O89110 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Casp8O89110 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Casp8O89110 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Casp8O89110 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Casp8O89110 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Casp8O89110 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Casp8O89110 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Casp8O89110 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Casp8O89110 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Casp8O89110 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Casp8O89110 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Casp8O89110 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Casp8O89110 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Casp8O89110 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Casp8O89110 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Casp8O89110 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Casp8O89110 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Casp8O89110 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Casp8O89110 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Casp8O89110 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Casp8O89110 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Casp8O89110 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Casp8O89110 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Casp8O89110 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Casp8O89110 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Casp8O89110 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Casp8O89110 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Casp8O89110 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Casp8O89110 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Casp8O89110 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Casp8O89110 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Casp8O89110 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Casp8O89110 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Casp8O89110 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Casp8O89110 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Casp8O89110 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Casp8O89110 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Casp8O89110 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Casp8O89110 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Casp8O89110 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Casp8O89110 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Casp8O89110 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Casp8O89110 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Casp8O89110 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Casp8O89110 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Casp8O89110 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Casp8O89110 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Casp8O89110 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Casp8O89110 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Casp8O89110 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Casp8O89110 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Casp8O89110 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Casp8O89110 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Casp8O89110 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Casp8O89110 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Casp8O89110 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Casp8O89110 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Casp8O89110 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Casp8O89110 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Casp8O89110 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Casp8O89110 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Casp8O89110 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Casp8O89110 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Casp8O89110 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Casp8O89110 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Casp8O89110 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Casp8O89110 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Casp8O89110 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Casp8O89110 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Casp8O89110 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Casp8O89110 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Casp8O89110 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Casp8O89110 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Casp8O89110 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Casp8O89110 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Casp8O89110 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Casp8O89110 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Casp8O89110 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Casp8O89110 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Casp8O89110 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Casp8O89110 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Casp8O89110 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Casp8O89110 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Casp8O89110 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms