Protein–RNA interactions for Protein: O88907

Pias1, E3 SUMO-protein ligase PIAS1, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pias1O88907 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pias1O88907 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pias1O88907 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pias1O88907 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pias1O88907 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Pias1O88907 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pias1O88907 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pias1O88907 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pias1O88907 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pias1O88907 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pias1O88907 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pias1O88907 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pias1O88907 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pias1O88907 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pias1O88907 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pias1O88907 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pias1O88907 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pias1O88907 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Pias1O88907 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pias1O88907 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pias1O88907 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Pias1O88907 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pias1O88907 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pias1O88907 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Pias1O88907 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pias1O88907 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pias1O88907 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pias1O88907 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pias1O88907 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Pias1O88907 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pias1O88907 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pias1O88907 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Pias1O88907 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pias1O88907 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pias1O88907 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pias1O88907 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pias1O88907 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pias1O88907 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pias1O88907 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pias1O88907 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pias1O88907 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pias1O88907 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pias1O88907 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pias1O88907 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pias1O88907 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pias1O88907 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pias1O88907 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pias1O88907 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pias1O88907 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pias1O88907 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pias1O88907 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pias1O88907 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pias1O88907 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pias1O88907 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pias1O88907 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pias1O88907 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Pias1O88907 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pias1O88907 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pias1O88907 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pias1O88907 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pias1O88907 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pias1O88907 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pias1O88907 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pias1O88907 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pias1O88907 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pias1O88907 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pias1O88907 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pias1O88907 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pias1O88907 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pias1O88907 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pias1O88907 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pias1O88907 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pias1O88907 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pias1O88907 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pias1O88907 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pias1O88907 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pias1O88907 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pias1O88907 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Pias1O88907 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pias1O88907 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pias1O88907 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pias1O88907 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pias1O88907 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pias1O88907 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pias1O88907 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pias1O88907 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Pias1O88907 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pias1O88907 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pias1O88907 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pias1O88907 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pias1O88907 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pias1O88907 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pias1O88907 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pias1O88907 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pias1O88907 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pias1O88907 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pias1O88907 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pias1O88907 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pias1O88907 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pias1O88907 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms