Protein–RNA interactions for Protein: O88705

Hcn3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn3O88705 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hcn3O88705 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hcn3O88705 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hcn3O88705 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hcn3O88705 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hcn3O88705 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hcn3O88705 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hcn3O88705 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hcn3O88705 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hcn3O88705 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hcn3O88705 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Hcn3O88705 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hcn3O88705 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hcn3O88705 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hcn3O88705 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hcn3O88705 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hcn3O88705 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hcn3O88705 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hcn3O88705 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hcn3O88705 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hcn3O88705 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hcn3O88705 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hcn3O88705 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hcn3O88705 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hcn3O88705 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hcn3O88705 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hcn3O88705 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hcn3O88705 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hcn3O88705 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hcn3O88705 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hcn3O88705 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hcn3O88705 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hcn3O88705 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Hcn3O88705 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hcn3O88705 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hcn3O88705 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hcn3O88705 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hcn3O88705 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hcn3O88705 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hcn3O88705 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hcn3O88705 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hcn3O88705 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hcn3O88705 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hcn3O88705 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hcn3O88705 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hcn3O88705 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hcn3O88705 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hcn3O88705 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hcn3O88705 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hcn3O88705 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hcn3O88705 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hcn3O88705 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hcn3O88705 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hcn3O88705 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hcn3O88705 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hcn3O88705 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hcn3O88705 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hcn3O88705 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hcn3O88705 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hcn3O88705 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Hcn3O88705 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hcn3O88705 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Hcn3O88705 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hcn3O88705 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hcn3O88705 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hcn3O88705 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hcn3O88705 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hcn3O88705 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hcn3O88705 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hcn3O88705 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hcn3O88705 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hcn3O88705 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hcn3O88705 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hcn3O88705 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hcn3O88705 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hcn3O88705 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hcn3O88705 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hcn3O88705 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hcn3O88705 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hcn3O88705 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hcn3O88705 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Hcn3O88705 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hcn3O88705 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hcn3O88705 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hcn3O88705 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hcn3O88705 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hcn3O88705 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hcn3O88705 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hcn3O88705 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hcn3O88705 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hcn3O88705 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hcn3O88705 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hcn3O88705 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hcn3O88705 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hcn3O88705 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Hcn3O88705 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hcn3O88705 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Hcn3O88705 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hcn3O88705 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hcn3O88705 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms