Protein–RNA interactions for Protein: O88632

Sema3f, Semaphorin-3F, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3fO88632 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Sema3fO88632 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Sema3fO88632 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Sema3fO88632 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Sema3fO88632 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Sema3fO88632 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Sema3fO88632 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Sema3fO88632 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Sema3fO88632 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Sema3fO88632 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sema3fO88632 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sema3fO88632 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Sema3fO88632 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sema3fO88632 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Sema3fO88632 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sema3fO88632 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Sema3fO88632 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Sema3fO88632 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sema3fO88632 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sema3fO88632 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sema3fO88632 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sema3fO88632 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sema3fO88632 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sema3fO88632 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sema3fO88632 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Sema3fO88632 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sema3fO88632 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sema3fO88632 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Sema3fO88632 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Sema3fO88632 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Sema3fO88632 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Sema3fO88632 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Sema3fO88632 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Sema3fO88632 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Sema3fO88632 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Sema3fO88632 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Sema3fO88632 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sema3fO88632 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Sema3fO88632 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Sema3fO88632 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Sema3fO88632 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Sema3fO88632 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sema3fO88632 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sema3fO88632 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sema3fO88632 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sema3fO88632 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sema3fO88632 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sema3fO88632 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Sema3fO88632 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Sema3fO88632 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Sema3fO88632 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Sema3fO88632 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Sema3fO88632 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Sema3fO88632 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Sema3fO88632 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Sema3fO88632 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Sema3fO88632 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Sema3fO88632 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Sema3fO88632 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Sema3fO88632 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sema3fO88632 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Sema3fO88632 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Sema3fO88632 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Sema3fO88632 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Sema3fO88632 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Sema3fO88632 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Sema3fO88632 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Sema3fO88632 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Sema3fO88632 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sema3fO88632 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Sema3fO88632 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Sema3fO88632 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sema3fO88632 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Sema3fO88632 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Sema3fO88632 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Sema3fO88632 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Sema3fO88632 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Sema3fO88632 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Sema3fO88632 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Sema3fO88632 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sema3fO88632 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Sema3fO88632 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Sema3fO88632 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Sema3fO88632 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Sema3fO88632 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Sema3fO88632 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Sema3fO88632 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Sema3fO88632 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sema3fO88632 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sema3fO88632 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Sema3fO88632 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Sema3fO88632 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Sema3fO88632 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sema3fO88632 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Sema3fO88632 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Sema3fO88632 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Sema3fO88632 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Sema3fO88632 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Sema3fO88632 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Sema3fO88632 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.4 ms