Protein–RNA interactions for Protein: O88543

Cops3, COP9 signalosome complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops3O88543 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cops3O88543 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cops3O88543 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cops3O88543 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cops3O88543 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cops3O88543 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cops3O88543 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cops3O88543 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cops3O88543 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cops3O88543 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cops3O88543 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cops3O88543 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cops3O88543 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cops3O88543 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cops3O88543 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cops3O88543 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cops3O88543 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cops3O88543 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cops3O88543 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cops3O88543 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cops3O88543 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cops3O88543 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cops3O88543 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cops3O88543 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cops3O88543 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cops3O88543 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cops3O88543 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cops3O88543 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cops3O88543 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cops3O88543 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cops3O88543 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cops3O88543 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cops3O88543 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cops3O88543 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cops3O88543 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cops3O88543 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cops3O88543 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cops3O88543 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cops3O88543 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cops3O88543 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cops3O88543 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cops3O88543 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cops3O88543 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cops3O88543 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cops3O88543 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cops3O88543 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cops3O88543 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cops3O88543 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cops3O88543 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cops3O88543 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cops3O88543 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cops3O88543 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cops3O88543 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cops3O88543 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cops3O88543 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cops3O88543 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cops3O88543 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cops3O88543 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cops3O88543 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cops3O88543 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cops3O88543 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cops3O88543 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cops3O88543 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cops3O88543 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cops3O88543 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cops3O88543 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cops3O88543 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cops3O88543 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cops3O88543 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cops3O88543 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cops3O88543 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cops3O88543 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cops3O88543 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cops3O88543 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cops3O88543 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cops3O88543 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cops3O88543 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cops3O88543 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cops3O88543 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cops3O88543 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cops3O88543 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cops3O88543 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cops3O88543 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cops3O88543 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cops3O88543 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cops3O88543 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cops3O88543 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cops3O88543 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cops3O88543 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cops3O88543 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cops3O88543 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cops3O88543 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cops3O88543 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cops3O88543 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cops3O88543 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cops3O88543 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cops3O88543 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cops3O88543 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cops3O88543 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cops3O88543 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms