Protein–RNA interactions for Protein: O88454

Kcnk4, Potassium channel subfamily K member 4, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk4O88454 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kcnk4O88454 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kcnk4O88454 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kcnk4O88454 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kcnk4O88454 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kcnk4O88454 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kcnk4O88454 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Kcnk4O88454 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Kcnk4O88454 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kcnk4O88454 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kcnk4O88454 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kcnk4O88454 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kcnk4O88454 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kcnk4O88454 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kcnk4O88454 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kcnk4O88454 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kcnk4O88454 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kcnk4O88454 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kcnk4O88454 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kcnk4O88454 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kcnk4O88454 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kcnk4O88454 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kcnk4O88454 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Kcnk4O88454 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kcnk4O88454 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kcnk4O88454 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kcnk4O88454 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kcnk4O88454 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kcnk4O88454 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Kcnk4O88454 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kcnk4O88454 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kcnk4O88454 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kcnk4O88454 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kcnk4O88454 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Kcnk4O88454 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kcnk4O88454 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kcnk4O88454 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kcnk4O88454 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kcnk4O88454 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Kcnk4O88454 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kcnk4O88454 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kcnk4O88454 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kcnk4O88454 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kcnk4O88454 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kcnk4O88454 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kcnk4O88454 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kcnk4O88454 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kcnk4O88454 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kcnk4O88454 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kcnk4O88454 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kcnk4O88454 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kcnk4O88454 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kcnk4O88454 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kcnk4O88454 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kcnk4O88454 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kcnk4O88454 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kcnk4O88454 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kcnk4O88454 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kcnk4O88454 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kcnk4O88454 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kcnk4O88454 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kcnk4O88454 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kcnk4O88454 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kcnk4O88454 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kcnk4O88454 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kcnk4O88454 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kcnk4O88454 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kcnk4O88454 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kcnk4O88454 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kcnk4O88454 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kcnk4O88454 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kcnk4O88454 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kcnk4O88454 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Kcnk4O88454 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Kcnk4O88454 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Kcnk4O88454 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Kcnk4O88454 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kcnk4O88454 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kcnk4O88454 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kcnk4O88454 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kcnk4O88454 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kcnk4O88454 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kcnk4O88454 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kcnk4O88454 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kcnk4O88454 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Kcnk4O88454 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kcnk4O88454 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kcnk4O88454 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Kcnk4O88454 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kcnk4O88454 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kcnk4O88454 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Kcnk4O88454 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kcnk4O88454 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kcnk4O88454 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Kcnk4O88454 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kcnk4O88454 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kcnk4O88454 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kcnk4O88454 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kcnk4O88454 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kcnk4O88454 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms