Protein–RNA interactions for Protein: O70578

Cacng1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng1O70578 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cacng1O70578 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cacng1O70578 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cacng1O70578 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cacng1O70578 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cacng1O70578 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacng1O70578 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacng1O70578 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacng1O70578 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cacng1O70578 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cacng1O70578 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cacng1O70578 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cacng1O70578 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cacng1O70578 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cacng1O70578 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cacng1O70578 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacng1O70578 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacng1O70578 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacng1O70578 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cacng1O70578 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cacng1O70578 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cacng1O70578 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cacng1O70578 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cacng1O70578 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cacng1O70578 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cacng1O70578 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cacng1O70578 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cacng1O70578 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cacng1O70578 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cacng1O70578 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cacng1O70578 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cacng1O70578 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cacng1O70578 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cacng1O70578 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cacng1O70578 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cacng1O70578 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cacng1O70578 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cacng1O70578 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacng1O70578 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacng1O70578 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cacng1O70578 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cacng1O70578 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cacng1O70578 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacng1O70578 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacng1O70578 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cacng1O70578 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cacng1O70578 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cacng1O70578 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cacng1O70578 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cacng1O70578 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cacng1O70578 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cacng1O70578 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cacng1O70578 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cacng1O70578 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cacng1O70578 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacng1O70578 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacng1O70578 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cacng1O70578 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cacng1O70578 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cacng1O70578 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cacng1O70578 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cacng1O70578 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacng1O70578 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacng1O70578 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cacng1O70578 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cacng1O70578 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cacng1O70578 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cacng1O70578 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cacng1O70578 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cacng1O70578 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cacng1O70578 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cacng1O70578 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cacng1O70578 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cacng1O70578 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cacng1O70578 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacng1O70578 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacng1O70578 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacng1O70578 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacng1O70578 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacng1O70578 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacng1O70578 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacng1O70578 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacng1O70578 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacng1O70578 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacng1O70578 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacng1O70578 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacng1O70578 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cacng1O70578 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cacng1O70578 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cacng1O70578 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cacng1O70578 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cacng1O70578 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cacng1O70578 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cacng1O70578 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cacng1O70578 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cacng1O70578 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cacng1O70578 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cacng1O70578 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cacng1O70578 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cacng1O70578 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms