Protein–RNA interactions for Protein: O70237

Gfi1b, Zinc finger protein Gfi-1b, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1bO70237 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gfi1bO70237 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gfi1bO70237 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gfi1bO70237 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gfi1bO70237 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gfi1bO70237 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gfi1bO70237 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gfi1bO70237 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gfi1bO70237 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gfi1bO70237 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gfi1bO70237 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gfi1bO70237 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gfi1bO70237 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gfi1bO70237 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gfi1bO70237 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gfi1bO70237 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gfi1bO70237 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gfi1bO70237 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gfi1bO70237 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Gfi1bO70237 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gfi1bO70237 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gfi1bO70237 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gfi1bO70237 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gfi1bO70237 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gfi1bO70237 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gfi1bO70237 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gfi1bO70237 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gfi1bO70237 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gfi1bO70237 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gfi1bO70237 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gfi1bO70237 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gfi1bO70237 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gfi1bO70237 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gfi1bO70237 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gfi1bO70237 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gfi1bO70237 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gfi1bO70237 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gfi1bO70237 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gfi1bO70237 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gfi1bO70237 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gfi1bO70237 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gfi1bO70237 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gfi1bO70237 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gfi1bO70237 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gfi1bO70237 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gfi1bO70237 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gfi1bO70237 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gfi1bO70237 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gfi1bO70237 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gfi1bO70237 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gfi1bO70237 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gfi1bO70237 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gfi1bO70237 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gfi1bO70237 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gfi1bO70237 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gfi1bO70237 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gfi1bO70237 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gfi1bO70237 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gfi1bO70237 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gfi1bO70237 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gfi1bO70237 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gfi1bO70237 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gfi1bO70237 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gfi1bO70237 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gfi1bO70237 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gfi1bO70237 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gfi1bO70237 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gfi1bO70237 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gfi1bO70237 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gfi1bO70237 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gfi1bO70237 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gfi1bO70237 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gfi1bO70237 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gfi1bO70237 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gfi1bO70237 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gfi1bO70237 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gfi1bO70237 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gfi1bO70237 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gfi1bO70237 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gfi1bO70237 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gfi1bO70237 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gfi1bO70237 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gfi1bO70237 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gfi1bO70237 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gfi1bO70237 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gfi1bO70237 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gfi1bO70237 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gfi1bO70237 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gfi1bO70237 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gfi1bO70237 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gfi1bO70237 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gfi1bO70237 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gfi1bO70237 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gfi1bO70237 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gfi1bO70237 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gfi1bO70237 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gfi1bO70237 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gfi1bO70237 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gfi1bO70237 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gfi1bO70237 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms