Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ChkbO55229 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ChkbO55229 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ChkbO55229 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ChkbO55229 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ChkbO55229 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ChkbO55229 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ChkbO55229 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ChkbO55229 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ChkbO55229 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ChkbO55229 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ChkbO55229 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ChkbO55229 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ChkbO55229 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ChkbO55229 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ChkbO55229 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ChkbO55229 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ChkbO55229 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ChkbO55229 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ChkbO55229 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ChkbO55229 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ChkbO55229 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ChkbO55229 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ChkbO55229 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ChkbO55229 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ChkbO55229 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ChkbO55229 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ChkbO55229 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ChkbO55229 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ChkbO55229 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ChkbO55229 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ChkbO55229 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ChkbO55229 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ChkbO55229 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ChkbO55229 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ChkbO55229 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ChkbO55229 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ChkbO55229 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ChkbO55229 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ChkbO55229 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ChkbO55229 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ChkbO55229 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ChkbO55229 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ChkbO55229 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ChkbO55229 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ChkbO55229 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ChkbO55229 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ChkbO55229 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ChkbO55229 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ChkbO55229 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ChkbO55229 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ChkbO55229 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ChkbO55229 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ChkbO55229 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ChkbO55229 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ChkbO55229 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ChkbO55229 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ChkbO55229 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ChkbO55229 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ChkbO55229 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ChkbO55229 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ChkbO55229 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ChkbO55229 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ChkbO55229 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ChkbO55229 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ChkbO55229 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ChkbO55229 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ChkbO55229 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ChkbO55229 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ChkbO55229 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ChkbO55229 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ChkbO55229 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ChkbO55229 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ChkbO55229 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ChkbO55229 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ChkbO55229 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ChkbO55229 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ChkbO55229 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ChkbO55229 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ChkbO55229 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ChkbO55229 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ChkbO55229 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ChkbO55229 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ChkbO55229 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ChkbO55229 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ChkbO55229 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ChkbO55229 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ChkbO55229 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ChkbO55229 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ChkbO55229 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ChkbO55229 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ChkbO55229 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ChkbO55229 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ChkbO55229 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ChkbO55229 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ChkbO55229 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ChkbO55229 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ChkbO55229 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ChkbO55229 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ChkbO55229 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 589.1 ms