Protein–RNA interactions for Protein: O55144

Tlx3, T-cell leukemia homeobox protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx3O55144 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tlx3O55144 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tlx3O55144 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tlx3O55144 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tlx3O55144 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tlx3O55144 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tlx3O55144 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tlx3O55144 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tlx3O55144 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tlx3O55144 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tlx3O55144 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tlx3O55144 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Tlx3O55144 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tlx3O55144 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tlx3O55144 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tlx3O55144 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tlx3O55144 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Tlx3O55144 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tlx3O55144 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tlx3O55144 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tlx3O55144 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Tlx3O55144 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tlx3O55144 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tlx3O55144 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tlx3O55144 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tlx3O55144 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tlx3O55144 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tlx3O55144 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tlx3O55144 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tlx3O55144 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tlx3O55144 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tlx3O55144 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tlx3O55144 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tlx3O55144 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tlx3O55144 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tlx3O55144 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Tlx3O55144 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tlx3O55144 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tlx3O55144 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Tlx3O55144 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tlx3O55144 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tlx3O55144 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tlx3O55144 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tlx3O55144 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tlx3O55144 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tlx3O55144 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tlx3O55144 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tlx3O55144 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tlx3O55144 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tlx3O55144 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tlx3O55144 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tlx3O55144 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tlx3O55144 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tlx3O55144 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tlx3O55144 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tlx3O55144 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tlx3O55144 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tlx3O55144 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tlx3O55144 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tlx3O55144 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tlx3O55144 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tlx3O55144 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tlx3O55144 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tlx3O55144 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tlx3O55144 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tlx3O55144 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tlx3O55144 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tlx3O55144 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tlx3O55144 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tlx3O55144 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tlx3O55144 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tlx3O55144 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tlx3O55144 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tlx3O55144 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tlx3O55144 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tlx3O55144 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tlx3O55144 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tlx3O55144 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tlx3O55144 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tlx3O55144 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tlx3O55144 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tlx3O55144 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tlx3O55144 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tlx3O55144 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tlx3O55144 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tlx3O55144 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tlx3O55144 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tlx3O55144 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tlx3O55144 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tlx3O55144 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tlx3O55144 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tlx3O55144 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tlx3O55144 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tlx3O55144 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tlx3O55144 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tlx3O55144 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tlx3O55144 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tlx3O55144 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tlx3O55144 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tlx3O55144 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms