Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trappc3O55013 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trappc3O55013 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trappc3O55013 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trappc3O55013 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trappc3O55013 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trappc3O55013 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trappc3O55013 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trappc3O55013 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trappc3O55013 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trappc3O55013 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trappc3O55013 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trappc3O55013 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trappc3O55013 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trappc3O55013 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trappc3O55013 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trappc3O55013 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trappc3O55013 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trappc3O55013 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trappc3O55013 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trappc3O55013 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trappc3O55013 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Trappc3O55013 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trappc3O55013 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trappc3O55013 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trappc3O55013 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trappc3O55013 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trappc3O55013 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trappc3O55013 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Trappc3O55013 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trappc3O55013 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trappc3O55013 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trappc3O55013 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trappc3O55013 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trappc3O55013 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trappc3O55013 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trappc3O55013 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trappc3O55013 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trappc3O55013 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trappc3O55013 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Trappc3O55013 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Trappc3O55013 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Trappc3O55013 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Trappc3O55013 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Trappc3O55013 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Trappc3O55013 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Trappc3O55013 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trappc3O55013 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trappc3O55013 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trappc3O55013 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trappc3O55013 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trappc3O55013 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trappc3O55013 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trappc3O55013 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trappc3O55013 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trappc3O55013 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Trappc3O55013 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Trappc3O55013 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trappc3O55013 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trappc3O55013 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trappc3O55013 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trappc3O55013 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trappc3O55013 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trappc3O55013 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trappc3O55013 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trappc3O55013 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trappc3O55013 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trappc3O55013 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trappc3O55013 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trappc3O55013 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trappc3O55013 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trappc3O55013 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trappc3O55013 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trappc3O55013 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trappc3O55013 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trappc3O55013 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trappc3O55013 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trappc3O55013 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trappc3O55013 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trappc3O55013 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trappc3O55013 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trappc3O55013 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trappc3O55013 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Trappc3O55013 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trappc3O55013 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trappc3O55013 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trappc3O55013 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trappc3O55013 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trappc3O55013 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trappc3O55013 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trappc3O55013 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trappc3O55013 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trappc3O55013 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trappc3O55013 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trappc3O55013 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trappc3O55013 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trappc3O55013 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trappc3O55013 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trappc3O55013 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trappc3O55013 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 333.6 ms