Protein–RNA interactions for Protein: O54891

Lgals6, Galectin-6, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgals6O54891 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lgals6O54891 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lgals6O54891 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lgals6O54891 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lgals6O54891 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lgals6O54891 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lgals6O54891 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lgals6O54891 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lgals6O54891 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lgals6O54891 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lgals6O54891 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lgals6O54891 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lgals6O54891 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lgals6O54891 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lgals6O54891 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lgals6O54891 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lgals6O54891 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lgals6O54891 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lgals6O54891 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lgals6O54891 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lgals6O54891 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lgals6O54891 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lgals6O54891 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lgals6O54891 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lgals6O54891 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lgals6O54891 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lgals6O54891 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lgals6O54891 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lgals6O54891 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lgals6O54891 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lgals6O54891 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lgals6O54891 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lgals6O54891 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lgals6O54891 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lgals6O54891 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lgals6O54891 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lgals6O54891 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lgals6O54891 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lgals6O54891 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lgals6O54891 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lgals6O54891 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lgals6O54891 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lgals6O54891 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lgals6O54891 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lgals6O54891 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lgals6O54891 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lgals6O54891 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Lgals6O54891 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lgals6O54891 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lgals6O54891 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lgals6O54891 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lgals6O54891 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lgals6O54891 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lgals6O54891 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lgals6O54891 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lgals6O54891 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lgals6O54891 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Lgals6O54891 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lgals6O54891 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lgals6O54891 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lgals6O54891 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lgals6O54891 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lgals6O54891 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lgals6O54891 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lgals6O54891 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lgals6O54891 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lgals6O54891 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lgals6O54891 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Lgals6O54891 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Lgals6O54891 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Lgals6O54891 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lgals6O54891 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lgals6O54891 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lgals6O54891 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lgals6O54891 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lgals6O54891 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lgals6O54891 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lgals6O54891 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lgals6O54891 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lgals6O54891 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Lgals6O54891 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lgals6O54891 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lgals6O54891 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lgals6O54891 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lgals6O54891 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lgals6O54891 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lgals6O54891 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lgals6O54891 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lgals6O54891 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lgals6O54891 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Lgals6O54891 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lgals6O54891 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Lgals6O54891 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lgals6O54891 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lgals6O54891 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lgals6O54891 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lgals6O54891 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lgals6O54891 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lgals6O54891 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lgals6O54891 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms