Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Itgb3O54890 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Itgb3O54890 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Itgb3O54890 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Itgb3O54890 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Itgb3O54890 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Itgb3O54890 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Itgb3O54890 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Itgb3O54890 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Itgb3O54890 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Itgb3O54890 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Itgb3O54890 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Itgb3O54890 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Itgb3O54890 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Itgb3O54890 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Itgb3O54890 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Itgb3O54890 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Itgb3O54890 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Itgb3O54890 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Itgb3O54890 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Itgb3O54890 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Itgb3O54890 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Itgb3O54890 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Itgb3O54890 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Itgb3O54890 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Itgb3O54890 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Itgb3O54890 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Itgb3O54890 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Itgb3O54890 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Itgb3O54890 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Itgb3O54890 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Itgb3O54890 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Itgb3O54890 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Itgb3O54890 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Itgb3O54890 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Itgb3O54890 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Itgb3O54890 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Itgb3O54890 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Itgb3O54890 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Itgb3O54890 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Itgb3O54890 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Itgb3O54890 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Itgb3O54890 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Itgb3O54890 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Itgb3O54890 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Itgb3O54890 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Itgb3O54890 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Itgb3O54890 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Itgb3O54890 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Itgb3O54890 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Itgb3O54890 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Itgb3O54890 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Itgb3O54890 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Itgb3O54890 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Itgb3O54890 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Itgb3O54890 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Itgb3O54890 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Itgb3O54890 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Itgb3O54890 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Itgb3O54890 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Itgb3O54890 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Itgb3O54890 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Itgb3O54890 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Itgb3O54890 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Itgb3O54890 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Itgb3O54890 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Itgb3O54890 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Itgb3O54890 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Itgb3O54890 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Itgb3O54890 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Itgb3O54890 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Itgb3O54890 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Itgb3O54890 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Itgb3O54890 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Itgb3O54890 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Itgb3O54890 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Itgb3O54890 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Itgb3O54890 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Itgb3O54890 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Itgb3O54890 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Itgb3O54890 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Itgb3O54890 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Itgb3O54890 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Itgb3O54890 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Itgb3O54890 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Itgb3O54890 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Itgb3O54890 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Itgb3O54890 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Itgb3O54890 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Itgb3O54890 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Itgb3O54890 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Itgb3O54890 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Itgb3O54890 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Itgb3O54890 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Itgb3O54890 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Itgb3O54890 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Itgb3O54890 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Itgb3O54890 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Itgb3O54890 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Itgb3O54890 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms