Protein–RNA interactions for Protein: O35973

Per1, Period circadian protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Per1O35973 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Per1O35973 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Per1O35973 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Per1O35973 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Per1O35973 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Per1O35973 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Per1O35973 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Per1O35973 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Per1O35973 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Per1O35973 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Per1O35973 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Per1O35973 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Per1O35973 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Per1O35973 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Per1O35973 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Per1O35973 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Per1O35973 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Per1O35973 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Per1O35973 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Per1O35973 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Per1O35973 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Per1O35973 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Per1O35973 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Per1O35973 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Per1O35973 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Per1O35973 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Per1O35973 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Per1O35973 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Per1O35973 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Per1O35973 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Per1O35973 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Per1O35973 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Per1O35973 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Per1O35973 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Per1O35973 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Per1O35973 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Per1O35973 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Per1O35973 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Per1O35973 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Per1O35973 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Per1O35973 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Per1O35973 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Per1O35973 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Per1O35973 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Per1O35973 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Per1O35973 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Per1O35973 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Per1O35973 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Per1O35973 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Per1O35973 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Per1O35973 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Per1O35973 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Per1O35973 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Per1O35973 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Per1O35973 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Per1O35973 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Per1O35973 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Per1O35973 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Per1O35973 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Per1O35973 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Per1O35973 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Per1O35973 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Per1O35973 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Per1O35973 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Per1O35973 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Per1O35973 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Per1O35973 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Per1O35973 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Per1O35973 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Per1O35973 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Per1O35973 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Per1O35973 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Per1O35973 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Per1O35973 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Per1O35973 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Per1O35973 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Per1O35973 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Per1O35973 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Per1O35973 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Per1O35973 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Per1O35973 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Per1O35973 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Per1O35973 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Per1O35973 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Per1O35973 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Per1O35973 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Per1O35973 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Per1O35973 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Per1O35973 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Per1O35973 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Per1O35973 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Per1O35973 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Per1O35973 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Per1O35973 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Per1O35973 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Per1O35973 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Per1O35973 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Per1O35973 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Per1O35973 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Per1O35973 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms