Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Ppfibp2O35711 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Ppfibp2O35711 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Ppfibp2O35711 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
Ppfibp2O35711 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ppfibp2O35711 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ppfibp2O35711 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
Ppfibp2O35711 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Ppfibp2O35711 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Ppfibp2O35711 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Ppfibp2O35711 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Ppfibp2O35711 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ppfibp2O35711 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Ppfibp2O35711 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Ppfibp2O35711 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Ppfibp2O35711 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Ppfibp2O35711 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Ppfibp2O35711 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Ppfibp2O35711 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Ppfibp2O35711 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Ppfibp2O35711 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Ppfibp2O35711 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Ppfibp2O35711 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Ppfibp2O35711 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Ppfibp2O35711 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Ppfibp2O35711 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Ppfibp2O35711 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Ppfibp2O35711 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Ppfibp2O35711 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Ppfibp2O35711 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Ppfibp2O35711 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Ppfibp2O35711 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Ppfibp2O35711 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Ppfibp2O35711 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Ppfibp2O35711 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Ppfibp2O35711 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Ppfibp2O35711 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Ppfibp2O35711 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Ppfibp2O35711 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Ppfibp2O35711 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
Ppfibp2O35711 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Ppfibp2O35711 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Ppfibp2O35711 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Ppfibp2O35711 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Ppfibp2O35711 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Ppfibp2O35711 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Ppfibp2O35711 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Ppfibp2O35711 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Ppfibp2O35711 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Ppfibp2O35711 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Ppfibp2O35711 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Ppfibp2O35711 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Ppfibp2O35711 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Ppfibp2O35711 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Ppfibp2O35711 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Ppfibp2O35711 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Ppfibp2O35711 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Ppfibp2O35711 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Ppfibp2O35711 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Ppfibp2O35711 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Ppfibp2O35711 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Ppfibp2O35711 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Ppfibp2O35711 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Ppfibp2O35711 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Ppfibp2O35711 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Ppfibp2O35711 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Ppfibp2O35711 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Ppfibp2O35711 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Ppfibp2O35711 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Ppfibp2O35711 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Ppfibp2O35711 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Ppfibp2O35711 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Ppfibp2O35711 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Ppfibp2O35711 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ppfibp2O35711 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ppfibp2O35711 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ppfibp2O35711 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ppfibp2O35711 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ppfibp2O35711 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ppfibp2O35711 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ppfibp2O35711 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ppfibp2O35711 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ppfibp2O35711 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ppfibp2O35711 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ppfibp2O35711 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ppfibp2O35711 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Ppfibp2O35711 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ppfibp2O35711 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ppfibp2O35711 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ppfibp2O35711 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ppfibp2O35711 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ppfibp2O35711 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ppfibp2O35711 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ppfibp2O35711 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ppfibp2O35711 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ppfibp2O35711 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Ppfibp2O35711 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Ppfibp2O35711 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Ppfibp2O35711 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ppfibp2O35711 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms