Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Xbp1O35426 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Xbp1O35426 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Xbp1O35426 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Xbp1O35426 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Xbp1O35426 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Xbp1O35426 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Xbp1O35426 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Xbp1O35426 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Xbp1O35426 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Xbp1O35426 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Xbp1O35426 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Xbp1O35426 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Xbp1O35426 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Xbp1O35426 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Xbp1O35426 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Xbp1O35426 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Xbp1O35426 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Xbp1O35426 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Xbp1O35426 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Xbp1O35426 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Xbp1O35426 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Xbp1O35426 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Xbp1O35426 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Xbp1O35426 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Xbp1O35426 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Xbp1O35426 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Xbp1O35426 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Xbp1O35426 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Xbp1O35426 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Xbp1O35426 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Xbp1O35426 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Xbp1O35426 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Xbp1O35426 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Xbp1O35426 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Xbp1O35426 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Xbp1O35426 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Xbp1O35426 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Xbp1O35426 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Xbp1O35426 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Xbp1O35426 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Xbp1O35426 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Xbp1O35426 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Xbp1O35426 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Xbp1O35426 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Xbp1O35426 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Xbp1O35426 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Xbp1O35426 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Xbp1O35426 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Xbp1O35426 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Xbp1O35426 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Xbp1O35426 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Xbp1O35426 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Xbp1O35426 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Xbp1O35426 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Xbp1O35426 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Xbp1O35426 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Xbp1O35426 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Xbp1O35426 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Xbp1O35426 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Xbp1O35426 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Xbp1O35426 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Xbp1O35426 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Xbp1O35426 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Xbp1O35426 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Xbp1O35426 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Xbp1O35426 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Xbp1O35426 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Xbp1O35426 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Xbp1O35426 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Xbp1O35426 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Xbp1O35426 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Xbp1O35426 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Xbp1O35426 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Xbp1O35426 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Xbp1O35426 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Xbp1O35426 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Xbp1O35426 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Xbp1O35426 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Xbp1O35426 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Xbp1O35426 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Xbp1O35426 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Xbp1O35426 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Xbp1O35426 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Xbp1O35426 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Xbp1O35426 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Xbp1O35426 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Xbp1O35426 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Xbp1O35426 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Xbp1O35426 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Xbp1O35426 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Xbp1O35426 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Xbp1O35426 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Xbp1O35426 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Xbp1O35426 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Xbp1O35426 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Xbp1O35426 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Xbp1O35426 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Xbp1O35426 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Xbp1O35426 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms