Protein–RNA interactions for Protein: O35343

Kpna4, Importin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna4O35343 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Kpna4O35343 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kpna4O35343 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kpna4O35343 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kpna4O35343 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kpna4O35343 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Kpna4O35343 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kpna4O35343 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kpna4O35343 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kpna4O35343 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kpna4O35343 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Kpna4O35343 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kpna4O35343 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kpna4O35343 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kpna4O35343 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kpna4O35343 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kpna4O35343 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kpna4O35343 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kpna4O35343 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kpna4O35343 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Kpna4O35343 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kpna4O35343 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kpna4O35343 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kpna4O35343 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kpna4O35343 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kpna4O35343 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kpna4O35343 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kpna4O35343 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kpna4O35343 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kpna4O35343 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Kpna4O35343 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Kpna4O35343 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kpna4O35343 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Kpna4O35343 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kpna4O35343 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kpna4O35343 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Kpna4O35343 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kpna4O35343 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kpna4O35343 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Kpna4O35343 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kpna4O35343 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kpna4O35343 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Kpna4O35343 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Kpna4O35343 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Kpna4O35343 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Kpna4O35343 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Kpna4O35343 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Kpna4O35343 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Kpna4O35343 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Kpna4O35343 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kpna4O35343 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kpna4O35343 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kpna4O35343 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kpna4O35343 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Kpna4O35343 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Kpna4O35343 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Kpna4O35343 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kpna4O35343 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Kpna4O35343 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Kpna4O35343 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kpna4O35343 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kpna4O35343 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Kpna4O35343 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Kpna4O35343 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Kpna4O35343 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kpna4O35343 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kpna4O35343 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kpna4O35343 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kpna4O35343 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kpna4O35343 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kpna4O35343 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kpna4O35343 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kpna4O35343 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Kpna4O35343 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kpna4O35343 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kpna4O35343 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kpna4O35343 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kpna4O35343 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kpna4O35343 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kpna4O35343 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kpna4O35343 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kpna4O35343 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kpna4O35343 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kpna4O35343 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kpna4O35343 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kpna4O35343 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kpna4O35343 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kpna4O35343 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kpna4O35343 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kpna4O35343 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kpna4O35343 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kpna4O35343 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kpna4O35343 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Kpna4O35343 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Kpna4O35343 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kpna4O35343 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kpna4O35343 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kpna4O35343 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Kpna4O35343 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kpna4O35343 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms