Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC36,35■■■■□ 3,41
Pkd2O35245 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,32■■■■□ 3,41
Pkd2O35245 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,32■■■■□ 3,41
Pkd2O35245 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC36,31■■■■□ 3,4
Pkd2O35245 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,31■■■■□ 3,4
Pkd2O35245 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,3■■■■□ 3,4
Pkd2O35245 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,29■■■■□ 3,4
Pkd2O35245 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,28■■■■□ 3,4
Pkd2O35245 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC36,27■■■■□ 3,4
Pkd2O35245 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,26■■■■□ 3,39
Pkd2O35245 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,26■■■■□ 3,39
Pkd2O35245 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,24■■■■□ 3,39
Pkd2O35245 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,24■■■■□ 3,39
Pkd2O35245 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,24■■■■□ 3,39
Pkd2O35245 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36,24■■■■□ 3,39
Pkd2O35245 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC36,23■■■■□ 3,39
Pkd2O35245 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,23■■■■□ 3,39
Pkd2O35245 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,22■■■■□ 3,39
Pkd2O35245 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36,2■■■■□ 3,39
Pkd2O35245 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,19■■■■□ 3,38
Pkd2O35245 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,19■■■■□ 3,38
Pkd2O35245 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,19■■■■□ 3,38
Pkd2O35245 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC36,18■■■■□ 3,38
Pkd2O35245 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC36,17■■■■□ 3,38
Pkd2O35245 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,16■■■■□ 3,38
Pkd2O35245 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC36,15■■■■□ 3,38
Pkd2O35245 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,15■■■■□ 3,38
Pkd2O35245 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,13■■■■□ 3,37
Pkd2O35245 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC36,13■■■■□ 3,37
Pkd2O35245 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC36,12■■■■□ 3,37
Pkd2O35245 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC36,11■■■■□ 3,37
Pkd2O35245 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,11■■■■□ 3,37
Pkd2O35245 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC36,11■■■■□ 3,37
Pkd2O35245 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC36,09■■■■□ 3,37
Pkd2O35245 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,07■■■■□ 3,36
Pkd2O35245 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC36,06■■■■□ 3,36
Pkd2O35245 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC36,06■■■■□ 3,36
Pkd2O35245 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC36,06■■■■□ 3,36
Pkd2O35245 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC36,05■■■■□ 3,36
Pkd2O35245 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,05■■■■□ 3,36
Pkd2O35245 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36,02■■■■□ 3,36
Pkd2O35245 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3,35
Pkd2O35245 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC36■■■■□ 3,35
Pkd2O35245 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35,98■■■■□ 3,35
Pkd2O35245 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,96■■■■□ 3,35
Pkd2O35245 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,96■■■■□ 3,35
Pkd2O35245 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC35,95■■■■□ 3,35
Pkd2O35245 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC35,94■■■■□ 3,34
Pkd2O35245 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,94■■■■□ 3,34
Pkd2O35245 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,93■■■■□ 3,34
Pkd2O35245 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,92■■■■□ 3,34
Pkd2O35245 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,91■■■■□ 3,34
Pkd2O35245 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,91■■■■□ 3,34
Pkd2O35245 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC35,91■■■■□ 3,34
Pkd2O35245 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,9■■■■□ 3,34
Pkd2O35245 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,89■■■■□ 3,34
Pkd2O35245 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC35,87■■■■□ 3,33
Pkd2O35245 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC35,87■■■■□ 3,33
Pkd2O35245 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC35,86■■■■□ 3,33
Pkd2O35245 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,86■■■■□ 3,33
Pkd2O35245 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,85■■■■□ 3,33
Pkd2O35245 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC35,85■■■■□ 3,33
Pkd2O35245 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,83■■■■□ 3,33
Pkd2O35245 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,82■■■■□ 3,32
Pkd2O35245 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35,8■■■■□ 3,32
Pkd2O35245 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,8■■■■□ 3,32
Pkd2O35245 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC35,79■■■■□ 3,32
Pkd2O35245 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC35,78■■■■□ 3,32
Pkd2O35245 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,78■■■■□ 3,32
Pkd2O35245 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,76■■■■□ 3,32
Pkd2O35245 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35,76■■■■□ 3,32
Pkd2O35245 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,76■■■■□ 3,31
Pkd2O35245 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35,75■■■■□ 3,31
Pkd2O35245 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,75■■■■□ 3,31
Pkd2O35245 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,74■■■■□ 3,31
Pkd2O35245 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC35,72■■■■□ 3,31
Pkd2O35245 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC35,71■■■■□ 3,31
Pkd2O35245 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC35,71■■■■□ 3,31
Pkd2O35245 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC35,69■■■■□ 3,3
Pkd2O35245 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC35,69■■■■□ 3,3
Pkd2O35245 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC35,68■■■■□ 3,3
Pkd2O35245 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC35,67■■■■□ 3,3
Pkd2O35245 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,67■■■■□ 3,3
Pkd2O35245 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC35,66■■■■□ 3,3
Pkd2O35245 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,66■■■■□ 3,3
Pkd2O35245 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,66■■■■□ 3,3
Pkd2O35245 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC35,65■■■■□ 3,3
Pkd2O35245 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,65■■■■□ 3,3
Pkd2O35245 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,63■■■■□ 3,29
Pkd2O35245 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,63■■■■□ 3,29
Pkd2O35245 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC35,62■■■■□ 3,29
Pkd2O35245 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,62■■■■□ 3,29
Pkd2O35245 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC35,61■■■■□ 3,29
Pkd2O35245 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,61■■■■□ 3,29
Pkd2O35245 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC35,6■■■■□ 3,29
Pkd2O35245 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC35,6■■■■□ 3,29
Pkd2O35245 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,59■■■■□ 3,29
Pkd2O35245 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,58■■■■□ 3,29
Pkd2O35245 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC35,57■■■■□ 3,29
Pkd2O35245 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC35,57■■■■□ 3,29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,4 ms