Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Pkd2O35245 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
Pkd2O35245 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
Pkd2O35245 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Pkd2O35245 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Pkd2O35245 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Pkd2O35245 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Pkd2O35245 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Pkd2O35245 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
Pkd2O35245 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Pkd2O35245 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Pkd2O35245 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Pkd2O35245 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Pkd2O35245 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Pkd2O35245 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Pkd2O35245 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Pkd2O35245 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Pkd2O35245 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Pkd2O35245 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Pkd2O35245 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Pkd2O35245 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Pkd2O35245 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Pkd2O35245 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
Pkd2O35245 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Pkd2O35245 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Pkd2O35245 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Pkd2O35245 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Pkd2O35245 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Pkd2O35245 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Pkd2O35245 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Pkd2O35245 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Pkd2O35245 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Pkd2O35245 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Pkd2O35245 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
Pkd2O35245 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Pkd2O35245 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Pkd2O35245 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Pkd2O35245 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Pkd2O35245 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Pkd2O35245 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Pkd2O35245 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Pkd2O35245 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Pkd2O35245 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC36■■■■□ 3.35
Pkd2O35245 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Pkd2O35245 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Pkd2O35245 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Pkd2O35245 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Pkd2O35245 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Pkd2O35245 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Pkd2O35245 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Pkd2O35245 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Pkd2O35245 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Pkd2O35245 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Pkd2O35245 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
Pkd2O35245 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Pkd2O35245 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Pkd2O35245 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Pkd2O35245 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Pkd2O35245 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Pkd2O35245 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Pkd2O35245 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Pkd2O35245 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Pkd2O35245 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Pkd2O35245 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Pkd2O35245 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Pkd2O35245 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Pkd2O35245 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Pkd2O35245 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Pkd2O35245 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Pkd2O35245 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Pkd2O35245 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
Pkd2O35245 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Pkd2O35245 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Pkd2O35245 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Pkd2O35245 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Pkd2O35245 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
Pkd2O35245 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
Pkd2O35245 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
Pkd2O35245 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Pkd2O35245 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Pkd2O35245 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
Pkd2O35245 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Pkd2O35245 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Pkd2O35245 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Pkd2O35245 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Pkd2O35245 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Pkd2O35245 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Pkd2O35245 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Pkd2O35245 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Pkd2O35245 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Pkd2O35245 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Pkd2O35245 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Pkd2O35245 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Pkd2O35245 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Pkd2O35245 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Pkd2O35245 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Pkd2O35245 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Pkd2O35245 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Pkd2O35245 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.29
Pkd2O35245 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms