Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Casq1O09165 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Casq1O09165 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Casq1O09165 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Casq1O09165 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Casq1O09165 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Casq1O09165 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Casq1O09165 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Casq1O09165 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Casq1O09165 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Casq1O09165 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Casq1O09165 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Casq1O09165 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Casq1O09165 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Casq1O09165 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Casq1O09165 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Casq1O09165 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Casq1O09165 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Casq1O09165 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Casq1O09165 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Casq1O09165 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Casq1O09165 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Casq1O09165 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Casq1O09165 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Casq1O09165 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Casq1O09165 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Casq1O09165 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Casq1O09165 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Casq1O09165 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Casq1O09165 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Casq1O09165 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Casq1O09165 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Casq1O09165 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Casq1O09165 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Casq1O09165 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Casq1O09165 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Casq1O09165 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Casq1O09165 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Casq1O09165 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Casq1O09165 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Casq1O09165 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Casq1O09165 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Casq1O09165 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Casq1O09165 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Casq1O09165 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Casq1O09165 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Casq1O09165 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Casq1O09165 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Casq1O09165 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Casq1O09165 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Casq1O09165 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Casq1O09165 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Casq1O09165 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Casq1O09165 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Casq1O09165 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Casq1O09165 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Casq1O09165 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Casq1O09165 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Casq1O09165 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Casq1O09165 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Casq1O09165 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Casq1O09165 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Casq1O09165 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Casq1O09165 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Casq1O09165 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Casq1O09165 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Casq1O09165 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Casq1O09165 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Casq1O09165 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Casq1O09165 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Casq1O09165 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Casq1O09165 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Casq1O09165 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Casq1O09165 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Casq1O09165 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Casq1O09165 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Casq1O09165 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Casq1O09165 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Casq1O09165 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Casq1O09165 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Casq1O09165 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Casq1O09165 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Casq1O09165 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Casq1O09165 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Casq1O09165 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Casq1O09165 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Casq1O09165 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Casq1O09165 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Casq1O09165 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Casq1O09165 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Casq1O09165 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Casq1O09165 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Casq1O09165 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Casq1O09165 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Casq1O09165 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Casq1O09165 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Casq1O09165 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Casq1O09165 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Casq1O09165 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Casq1O09165 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
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