Protein–RNA interactions for Protein: O08976

Pbsn, Probasin, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PbsnO08976 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PbsnO08976 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PbsnO08976 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PbsnO08976 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PbsnO08976 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PbsnO08976 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PbsnO08976 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PbsnO08976 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PbsnO08976 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PbsnO08976 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PbsnO08976 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PbsnO08976 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PbsnO08976 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PbsnO08976 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PbsnO08976 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PbsnO08976 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PbsnO08976 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PbsnO08976 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PbsnO08976 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PbsnO08976 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PbsnO08976 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PbsnO08976 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PbsnO08976 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PbsnO08976 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PbsnO08976 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PbsnO08976 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PbsnO08976 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PbsnO08976 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PbsnO08976 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PbsnO08976 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PbsnO08976 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PbsnO08976 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PbsnO08976 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PbsnO08976 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PbsnO08976 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PbsnO08976 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PbsnO08976 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PbsnO08976 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PbsnO08976 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PbsnO08976 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PbsnO08976 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PbsnO08976 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PbsnO08976 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PbsnO08976 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PbsnO08976 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PbsnO08976 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PbsnO08976 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PbsnO08976 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PbsnO08976 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PbsnO08976 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PbsnO08976 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PbsnO08976 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PbsnO08976 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PbsnO08976 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PbsnO08976 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PbsnO08976 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PbsnO08976 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PbsnO08976 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PbsnO08976 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PbsnO08976 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PbsnO08976 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PbsnO08976 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PbsnO08976 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PbsnO08976 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PbsnO08976 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PbsnO08976 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PbsnO08976 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PbsnO08976 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PbsnO08976 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PbsnO08976 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PbsnO08976 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PbsnO08976 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PbsnO08976 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PbsnO08976 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PbsnO08976 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PbsnO08976 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PbsnO08976 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PbsnO08976 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PbsnO08976 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PbsnO08976 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PbsnO08976 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PbsnO08976 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PbsnO08976 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PbsnO08976 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PbsnO08976 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PbsnO08976 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PbsnO08976 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PbsnO08976 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PbsnO08976 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PbsnO08976 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PbsnO08976 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PbsnO08976 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PbsnO08976 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PbsnO08976 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PbsnO08976 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PbsnO08976 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PbsnO08976 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PbsnO08976 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PbsnO08976 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PbsnO08976 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms