Protein–RNA interactions for Protein: O08976

Pbsn, Probasin, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PbsnO08976 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25,22■■□□□ 1,63
PbsnO08976 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
PbsnO08976 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
PbsnO08976 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25,21■■□□□ 1,63
PbsnO08976 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,2■■□□□ 1,63
PbsnO08976 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25,2■■□□□ 1,62
PbsnO08976 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
PbsnO08976 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
PbsnO08976 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
PbsnO08976 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25,18■■□□□ 1,62
PbsnO08976 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
PbsnO08976 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
PbsnO08976 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
PbsnO08976 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
PbsnO08976 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
PbsnO08976 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
PbsnO08976 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25,17■■□□□ 1,62
PbsnO08976 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
PbsnO08976 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
PbsnO08976 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
PbsnO08976 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
PbsnO08976 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,15■■□□□ 1,62
PbsnO08976 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,15■■□□□ 1,62
PbsnO08976 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,14■■□□□ 1,62
PbsnO08976 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25,14■■□□□ 1,62
PbsnO08976 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
PbsnO08976 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
PbsnO08976 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
PbsnO08976 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
PbsnO08976 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25,1■■□□□ 1,61
PbsnO08976 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,1■■□□□ 1,61
PbsnO08976 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
PbsnO08976 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
PbsnO08976 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25,09■■□□□ 1,61
PbsnO08976 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25,06■■□□□ 1,6
PbsnO08976 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
PbsnO08976 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25,05■■□□□ 1,6
PbsnO08976 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
PbsnO08976 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
PbsnO08976 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
PbsnO08976 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
PbsnO08976 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
PbsnO08976 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
PbsnO08976 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
PbsnO08976 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
PbsnO08976 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
PbsnO08976 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
PbsnO08976 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
PbsnO08976 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
PbsnO08976 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,02■■□□□ 1,6
PbsnO08976 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1,59
PbsnO08976 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
PbsnO08976 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
PbsnO08976 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24,97■■□□□ 1,59
PbsnO08976 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
PbsnO08976 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24,96■■□□□ 1,59
PbsnO08976 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,58
PbsnO08976 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24,93■■□□□ 1,58
PbsnO08976 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24,93■■□□□ 1,58
PbsnO08976 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
PbsnO08976 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,93■■□□□ 1,58
PbsnO08976 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
PbsnO08976 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
PbsnO08976 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,58
PbsnO08976 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,58
PbsnO08976 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,58
PbsnO08976 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,57
PbsnO08976 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
PbsnO08976 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
PbsnO08976 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24,88■■□□□ 1,57
PbsnO08976 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,88■■□□□ 1,57
PbsnO08976 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24,88■■□□□ 1,57
PbsnO08976 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24,87■■□□□ 1,57
PbsnO08976 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
PbsnO08976 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
PbsnO08976 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,85■■□□□ 1,57
PbsnO08976 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24,85■■□□□ 1,57
PbsnO08976 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
PbsnO08976 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
PbsnO08976 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
PbsnO08976 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,81■■□□□ 1,56
PbsnO08976 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
PbsnO08976 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
PbsnO08976 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
PbsnO08976 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24,79■■□□□ 1,56
PbsnO08976 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
PbsnO08976 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
PbsnO08976 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
PbsnO08976 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
PbsnO08976 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,76■■□□□ 1,55
PbsnO08976 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
PbsnO08976 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
PbsnO08976 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
PbsnO08976 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
PbsnO08976 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,74■■□□□ 1,55
PbsnO08976 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
PbsnO08976 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
PbsnO08976 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
PbsnO08976 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24,72■■□□□ 1,55
PbsnO08976 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,4 ms