Protein–RNA interactions for Protein: O08792

Ebf2, Transcription factor COE2, mousemouse

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf2O08792 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ebf2O08792 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ebf2O08792 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ebf2O08792 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ebf2O08792 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ebf2O08792 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ebf2O08792 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ebf2O08792 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ebf2O08792 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ebf2O08792 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ebf2O08792 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ebf2O08792 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ebf2O08792 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ebf2O08792 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ebf2O08792 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ebf2O08792 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ebf2O08792 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ebf2O08792 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ebf2O08792 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ebf2O08792 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ebf2O08792 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ebf2O08792 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ebf2O08792 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ebf2O08792 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ebf2O08792 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ebf2O08792 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ebf2O08792 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ebf2O08792 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ebf2O08792 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ebf2O08792 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ebf2O08792 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ebf2O08792 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ebf2O08792 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ebf2O08792 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ebf2O08792 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ebf2O08792 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ebf2O08792 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ebf2O08792 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ebf2O08792 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ebf2O08792 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ebf2O08792 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ebf2O08792 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ebf2O08792 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ebf2O08792 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ebf2O08792 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ebf2O08792 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ebf2O08792 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ebf2O08792 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ebf2O08792 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ebf2O08792 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ebf2O08792 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ebf2O08792 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ebf2O08792 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ebf2O08792 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ebf2O08792 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ebf2O08792 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ebf2O08792 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ebf2O08792 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ebf2O08792 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ebf2O08792 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ebf2O08792 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ebf2O08792 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ebf2O08792 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ebf2O08792 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ebf2O08792 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ebf2O08792 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ebf2O08792 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ebf2O08792 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ebf2O08792 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ebf2O08792 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ebf2O08792 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ebf2O08792 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ebf2O08792 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ebf2O08792 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ebf2O08792 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ebf2O08792 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ebf2O08792 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ebf2O08792 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ebf2O08792 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ebf2O08792 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ebf2O08792 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ebf2O08792 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ebf2O08792 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ebf2O08792 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ebf2O08792 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ebf2O08792 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ebf2O08792 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ebf2O08792 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ebf2O08792 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ebf2O08792 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ebf2O08792 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ebf2O08792 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ebf2O08792 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ebf2O08792 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ebf2O08792 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ebf2O08792 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ebf2O08792 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ebf2O08792 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ebf2O08792 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ebf2O08792 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms