Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP5

Gm21897, Predicted gene, 21897, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21897J3KMP5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm21897J3KMP5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm21897J3KMP5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm21897J3KMP5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm21897J3KMP5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm21897J3KMP5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm21897J3KMP5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm21897J3KMP5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm21897J3KMP5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm21897J3KMP5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm21897J3KMP5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm21897J3KMP5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm21897J3KMP5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm21897J3KMP5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm21897J3KMP5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm21897J3KMP5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm21897J3KMP5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm21897J3KMP5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm21897J3KMP5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm21897J3KMP5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm21897J3KMP5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm21897J3KMP5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm21897J3KMP5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm21897J3KMP5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm21897J3KMP5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm21897J3KMP5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm21897J3KMP5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm21897J3KMP5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm21897J3KMP5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm21897J3KMP5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm21897J3KMP5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm21897J3KMP5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm21897J3KMP5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm21897J3KMP5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm21897J3KMP5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm21897J3KMP5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm21897J3KMP5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm21897J3KMP5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm21897J3KMP5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm21897J3KMP5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm21897J3KMP5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm21897J3KMP5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm21897J3KMP5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm21897J3KMP5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm21897J3KMP5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm21897J3KMP5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm21897J3KMP5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm21897J3KMP5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm21897J3KMP5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm21897J3KMP5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm21897J3KMP5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm21897J3KMP5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm21897J3KMP5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm21897J3KMP5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm21897J3KMP5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm21897J3KMP5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm21897J3KMP5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm21897J3KMP5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm21897J3KMP5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm21897J3KMP5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm21897J3KMP5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm21897J3KMP5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm21897J3KMP5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm21897J3KMP5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm21897J3KMP5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm21897J3KMP5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm21897J3KMP5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm21897J3KMP5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm21897J3KMP5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm21897J3KMP5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm21897J3KMP5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm21897J3KMP5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm21897J3KMP5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm21897J3KMP5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm21897J3KMP5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm21897J3KMP5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm21897J3KMP5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm21897J3KMP5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm21897J3KMP5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gm21897J3KMP5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gm21897J3KMP5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm21897J3KMP5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm21897J3KMP5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm21897J3KMP5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm21897J3KMP5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm21897J3KMP5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm21897J3KMP5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm21897J3KMP5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm21897J3KMP5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm21897J3KMP5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm21897J3KMP5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm21897J3KMP5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm21897J3KMP5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm21897J3KMP5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm21897J3KMP5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm21897J3KMP5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm21897J3KMP5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm21897J3KMP5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm21897J3KMP5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm21897J3KMP5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms