Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r34G3XA52 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r34G3XA52 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r34G3XA52 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn1r34G3XA52 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn1r34G3XA52 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn1r34G3XA52 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn1r34G3XA52 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn1r34G3XA52 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn1r34G3XA52 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r34G3XA52 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r34G3XA52 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r34G3XA52 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r34G3XA52 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r34G3XA52 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r34G3XA52 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r34G3XA52 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn1r34G3XA52 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r34G3XA52 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vmn1r34G3XA52 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r34G3XA52 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r34G3XA52 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r34G3XA52 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Vmn1r34G3XA52 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vmn1r34G3XA52 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vmn1r34G3XA52 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn1r34G3XA52 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn1r34G3XA52 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r34G3XA52 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r34G3XA52 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r34G3XA52 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r34G3XA52 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r34G3XA52 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmn1r34G3XA52 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r34G3XA52 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r34G3XA52 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r34G3XA52 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn1r34G3XA52 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn1r34G3XA52 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn1r34G3XA52 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r34G3XA52 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn1r34G3XA52 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmn1r34G3XA52 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmn1r34G3XA52 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Vmn1r34G3XA52 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn1r34G3XA52 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn1r34G3XA52 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn1r34G3XA52 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn1r34G3XA52 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn1r34G3XA52 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmn1r34G3XA52 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn1r34G3XA52 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn1r34G3XA52 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn1r34G3XA52 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn1r34G3XA52 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn1r34G3XA52 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn1r34G3XA52 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn1r34G3XA52 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Vmn1r34G3XA52 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn1r34G3XA52 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn1r34G3XA52 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn1r34G3XA52 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vmn1r34G3XA52 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vmn1r34G3XA52 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn1r34G3XA52 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn1r34G3XA52 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn1r34G3XA52 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn1r34G3XA52 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmn1r34G3XA52 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmn1r34G3XA52 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vmn1r34G3XA52 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vmn1r34G3XA52 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn1r34G3XA52 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn1r34G3XA52 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn1r34G3XA52 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn1r34G3XA52 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn1r34G3XA52 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn1r34G3XA52 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn1r34G3XA52 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmn1r34G3XA52 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmn1r34G3XA52 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmn1r34G3XA52 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmn1r34G3XA52 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Vmn1r34G3XA52 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Vmn1r34G3XA52 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vmn1r34G3XA52 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn1r34G3XA52 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmn1r34G3XA52 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmn1r34G3XA52 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmn1r34G3XA52 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vmn1r34G3XA52 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vmn1r34G3XA52 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vmn1r34G3XA52 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vmn1r34G3XA52 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn1r34G3XA52 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn1r34G3XA52 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn1r34G3XA52 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmn1r34G3XA52 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vmn1r34G3XA52 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vmn1r34G3XA52 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms