Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nccrp1G3X9C2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Nccrp1G3X9C2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nccrp1G3X9C2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nccrp1G3X9C2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nccrp1G3X9C2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nccrp1G3X9C2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nccrp1G3X9C2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nccrp1G3X9C2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nccrp1G3X9C2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nccrp1G3X9C2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nccrp1G3X9C2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nccrp1G3X9C2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nccrp1G3X9C2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nccrp1G3X9C2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nccrp1G3X9C2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nccrp1G3X9C2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nccrp1G3X9C2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nccrp1G3X9C2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nccrp1G3X9C2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nccrp1G3X9C2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nccrp1G3X9C2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nccrp1G3X9C2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nccrp1G3X9C2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nccrp1G3X9C2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nccrp1G3X9C2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nccrp1G3X9C2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nccrp1G3X9C2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nccrp1G3X9C2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nccrp1G3X9C2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nccrp1G3X9C2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nccrp1G3X9C2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nccrp1G3X9C2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nccrp1G3X9C2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nccrp1G3X9C2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nccrp1G3X9C2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nccrp1G3X9C2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nccrp1G3X9C2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nccrp1G3X9C2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nccrp1G3X9C2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Nccrp1G3X9C2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nccrp1G3X9C2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nccrp1G3X9C2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nccrp1G3X9C2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nccrp1G3X9C2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nccrp1G3X9C2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nccrp1G3X9C2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nccrp1G3X9C2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nccrp1G3X9C2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nccrp1G3X9C2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nccrp1G3X9C2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nccrp1G3X9C2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Nccrp1G3X9C2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nccrp1G3X9C2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nccrp1G3X9C2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nccrp1G3X9C2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nccrp1G3X9C2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nccrp1G3X9C2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nccrp1G3X9C2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nccrp1G3X9C2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nccrp1G3X9C2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nccrp1G3X9C2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nccrp1G3X9C2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nccrp1G3X9C2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nccrp1G3X9C2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nccrp1G3X9C2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nccrp1G3X9C2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nccrp1G3X9C2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nccrp1G3X9C2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nccrp1G3X9C2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Nccrp1G3X9C2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nccrp1G3X9C2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nccrp1G3X9C2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nccrp1G3X9C2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nccrp1G3X9C2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nccrp1G3X9C2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Nccrp1G3X9C2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nccrp1G3X9C2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nccrp1G3X9C2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nccrp1G3X9C2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nccrp1G3X9C2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nccrp1G3X9C2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nccrp1G3X9C2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nccrp1G3X9C2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nccrp1G3X9C2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nccrp1G3X9C2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nccrp1G3X9C2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nccrp1G3X9C2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nccrp1G3X9C2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nccrp1G3X9C2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nccrp1G3X9C2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nccrp1G3X9C2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Nccrp1G3X9C2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nccrp1G3X9C2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nccrp1G3X9C2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nccrp1G3X9C2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nccrp1G3X9C2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nccrp1G3X9C2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Nccrp1G3X9C2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nccrp1G3X9C2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms