Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim55G3X8Y1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim55G3X8Y1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim55G3X8Y1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Trim55G3X8Y1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Trim55G3X8Y1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim55G3X8Y1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim55G3X8Y1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim55G3X8Y1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim55G3X8Y1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim55G3X8Y1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim55G3X8Y1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim55G3X8Y1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim55G3X8Y1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim55G3X8Y1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim55G3X8Y1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim55G3X8Y1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim55G3X8Y1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim55G3X8Y1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim55G3X8Y1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim55G3X8Y1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim55G3X8Y1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim55G3X8Y1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim55G3X8Y1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim55G3X8Y1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim55G3X8Y1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim55G3X8Y1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim55G3X8Y1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim55G3X8Y1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim55G3X8Y1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim55G3X8Y1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim55G3X8Y1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim55G3X8Y1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim55G3X8Y1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim55G3X8Y1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim55G3X8Y1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim55G3X8Y1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim55G3X8Y1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim55G3X8Y1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim55G3X8Y1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim55G3X8Y1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim55G3X8Y1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim55G3X8Y1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim55G3X8Y1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trim55G3X8Y1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trim55G3X8Y1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim55G3X8Y1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim55G3X8Y1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim55G3X8Y1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim55G3X8Y1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim55G3X8Y1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim55G3X8Y1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim55G3X8Y1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim55G3X8Y1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim55G3X8Y1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim55G3X8Y1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim55G3X8Y1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim55G3X8Y1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim55G3X8Y1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim55G3X8Y1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Trim55G3X8Y1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim55G3X8Y1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim55G3X8Y1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim55G3X8Y1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim55G3X8Y1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim55G3X8Y1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim55G3X8Y1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim55G3X8Y1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim55G3X8Y1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim55G3X8Y1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim55G3X8Y1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim55G3X8Y1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim55G3X8Y1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim55G3X8Y1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim55G3X8Y1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim55G3X8Y1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim55G3X8Y1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim55G3X8Y1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim55G3X8Y1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim55G3X8Y1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim55G3X8Y1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim55G3X8Y1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim55G3X8Y1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim55G3X8Y1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim55G3X8Y1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim55G3X8Y1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim55G3X8Y1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim55G3X8Y1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim55G3X8Y1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim55G3X8Y1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim55G3X8Y1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim55G3X8Y1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim55G3X8Y1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim55G3X8Y1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim55G3X8Y1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim55G3X8Y1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim55G3X8Y1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim55G3X8Y1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim55G3X8Y1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim55G3X8Y1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.9 ms