Protein–RNA interactions for Protein: F8VQB8

Npcd, Neuronal pentraxin chromo domain, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NpcdF8VQB8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NpcdF8VQB8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
NpcdF8VQB8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NpcdF8VQB8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NpcdF8VQB8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NpcdF8VQB8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NpcdF8VQB8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NpcdF8VQB8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
NpcdF8VQB8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NpcdF8VQB8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NpcdF8VQB8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
NpcdF8VQB8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
NpcdF8VQB8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
NpcdF8VQB8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NpcdF8VQB8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NpcdF8VQB8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NpcdF8VQB8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NpcdF8VQB8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NpcdF8VQB8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NpcdF8VQB8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NpcdF8VQB8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NpcdF8VQB8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
NpcdF8VQB8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NpcdF8VQB8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NpcdF8VQB8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
NpcdF8VQB8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
NpcdF8VQB8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NpcdF8VQB8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NpcdF8VQB8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NpcdF8VQB8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
NpcdF8VQB8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NpcdF8VQB8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NpcdF8VQB8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NpcdF8VQB8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NpcdF8VQB8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NpcdF8VQB8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NpcdF8VQB8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NpcdF8VQB8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NpcdF8VQB8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NpcdF8VQB8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NpcdF8VQB8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NpcdF8VQB8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NpcdF8VQB8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NpcdF8VQB8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NpcdF8VQB8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NpcdF8VQB8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NpcdF8VQB8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NpcdF8VQB8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
NpcdF8VQB8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NpcdF8VQB8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NpcdF8VQB8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NpcdF8VQB8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NpcdF8VQB8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NpcdF8VQB8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NpcdF8VQB8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NpcdF8VQB8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NpcdF8VQB8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NpcdF8VQB8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NpcdF8VQB8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NpcdF8VQB8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NpcdF8VQB8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NpcdF8VQB8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NpcdF8VQB8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NpcdF8VQB8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NpcdF8VQB8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NpcdF8VQB8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NpcdF8VQB8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NpcdF8VQB8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
NpcdF8VQB8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NpcdF8VQB8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NpcdF8VQB8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NpcdF8VQB8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NpcdF8VQB8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NpcdF8VQB8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NpcdF8VQB8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NpcdF8VQB8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
NpcdF8VQB8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NpcdF8VQB8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NpcdF8VQB8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NpcdF8VQB8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NpcdF8VQB8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NpcdF8VQB8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NpcdF8VQB8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NpcdF8VQB8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NpcdF8VQB8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NpcdF8VQB8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NpcdF8VQB8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NpcdF8VQB8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NpcdF8VQB8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NpcdF8VQB8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NpcdF8VQB8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NpcdF8VQB8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NpcdF8VQB8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NpcdF8VQB8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NpcdF8VQB8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NpcdF8VQB8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
NpcdF8VQB8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
NpcdF8VQB8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NpcdF8VQB8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NpcdF8VQB8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms