Protein–RNA interactions for Protein: F7D1B3

4933402N22Rik, RIKEN cDNA 4933402N22 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933402N22RikF7D1B3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
4933402N22RikF7D1B3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
4933402N22RikF7D1B3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4933402N22RikF7D1B3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4933402N22RikF7D1B3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
4933402N22RikF7D1B3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
4933402N22RikF7D1B3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
4933402N22RikF7D1B3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
4933402N22RikF7D1B3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
4933402N22RikF7D1B3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
4933402N22RikF7D1B3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4933402N22RikF7D1B3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
4933402N22RikF7D1B3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4933402N22RikF7D1B3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4933402N22RikF7D1B3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4933402N22RikF7D1B3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
4933402N22RikF7D1B3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4933402N22RikF7D1B3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4933402N22RikF7D1B3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4933402N22RikF7D1B3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4933402N22RikF7D1B3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4933402N22RikF7D1B3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4933402N22RikF7D1B3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4933402N22RikF7D1B3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
4933402N22RikF7D1B3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
4933402N22RikF7D1B3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4933402N22RikF7D1B3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
4933402N22RikF7D1B3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4933402N22RikF7D1B3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4933402N22RikF7D1B3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4933402N22RikF7D1B3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4933402N22RikF7D1B3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
4933402N22RikF7D1B3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
4933402N22RikF7D1B3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
4933402N22RikF7D1B3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4933402N22RikF7D1B3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
4933402N22RikF7D1B3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
4933402N22RikF7D1B3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
4933402N22RikF7D1B3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4933402N22RikF7D1B3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4933402N22RikF7D1B3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
4933402N22RikF7D1B3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4933402N22RikF7D1B3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4933402N22RikF7D1B3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4933402N22RikF7D1B3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4933402N22RikF7D1B3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
4933402N22RikF7D1B3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
4933402N22RikF7D1B3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4933402N22RikF7D1B3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
4933402N22RikF7D1B3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
4933402N22RikF7D1B3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
4933402N22RikF7D1B3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4933402N22RikF7D1B3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4933402N22RikF7D1B3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
4933402N22RikF7D1B3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
4933402N22RikF7D1B3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
4933402N22RikF7D1B3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
4933402N22RikF7D1B3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4933402N22RikF7D1B3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4933402N22RikF7D1B3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4933402N22RikF7D1B3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4933402N22RikF7D1B3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
4933402N22RikF7D1B3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
4933402N22RikF7D1B3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4933402N22RikF7D1B3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
4933402N22RikF7D1B3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
4933402N22RikF7D1B3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4933402N22RikF7D1B3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4933402N22RikF7D1B3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
4933402N22RikF7D1B3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4933402N22RikF7D1B3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4933402N22RikF7D1B3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4933402N22RikF7D1B3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4933402N22RikF7D1B3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
4933402N22RikF7D1B3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
4933402N22RikF7D1B3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4933402N22RikF7D1B3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
4933402N22RikF7D1B3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
4933402N22RikF7D1B3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
4933402N22RikF7D1B3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4933402N22RikF7D1B3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4933402N22RikF7D1B3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4933402N22RikF7D1B3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4933402N22RikF7D1B3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4933402N22RikF7D1B3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4933402N22RikF7D1B3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4933402N22RikF7D1B3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4933402N22RikF7D1B3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4933402N22RikF7D1B3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4933402N22RikF7D1B3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4933402N22RikF7D1B3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4933402N22RikF7D1B3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4933402N22RikF7D1B3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4933402N22RikF7D1B3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4933402N22RikF7D1B3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4933402N22RikF7D1B3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
4933402N22RikF7D1B3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
4933402N22RikF7D1B3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
4933402N22RikF7D1B3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
4933402N22RikF7D1B3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms