Protein–RNA interactions for Protein: F7CXE4

Gm7535, Predicted gene 7535, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7535F7CXE4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm7535F7CXE4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm7535F7CXE4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm7535F7CXE4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm7535F7CXE4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm7535F7CXE4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm7535F7CXE4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm7535F7CXE4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm7535F7CXE4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm7535F7CXE4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm7535F7CXE4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm7535F7CXE4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm7535F7CXE4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm7535F7CXE4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm7535F7CXE4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gm7535F7CXE4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm7535F7CXE4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm7535F7CXE4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm7535F7CXE4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm7535F7CXE4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm7535F7CXE4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm7535F7CXE4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm7535F7CXE4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm7535F7CXE4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm7535F7CXE4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm7535F7CXE4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm7535F7CXE4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm7535F7CXE4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm7535F7CXE4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm7535F7CXE4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm7535F7CXE4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm7535F7CXE4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm7535F7CXE4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm7535F7CXE4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm7535F7CXE4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm7535F7CXE4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm7535F7CXE4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm7535F7CXE4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm7535F7CXE4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm7535F7CXE4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm7535F7CXE4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm7535F7CXE4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm7535F7CXE4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm7535F7CXE4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm7535F7CXE4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm7535F7CXE4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm7535F7CXE4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm7535F7CXE4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm7535F7CXE4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm7535F7CXE4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm7535F7CXE4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm7535F7CXE4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm7535F7CXE4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm7535F7CXE4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm7535F7CXE4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm7535F7CXE4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm7535F7CXE4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm7535F7CXE4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm7535F7CXE4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm7535F7CXE4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm7535F7CXE4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm7535F7CXE4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm7535F7CXE4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm7535F7CXE4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm7535F7CXE4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm7535F7CXE4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm7535F7CXE4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm7535F7CXE4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm7535F7CXE4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm7535F7CXE4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm7535F7CXE4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm7535F7CXE4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm7535F7CXE4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm7535F7CXE4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm7535F7CXE4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm7535F7CXE4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm7535F7CXE4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm7535F7CXE4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm7535F7CXE4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm7535F7CXE4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm7535F7CXE4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm7535F7CXE4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm7535F7CXE4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm7535F7CXE4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm7535F7CXE4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm7535F7CXE4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm7535F7CXE4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm7535F7CXE4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Gm7535F7CXE4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm7535F7CXE4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm7535F7CXE4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm7535F7CXE4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm7535F7CXE4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm7535F7CXE4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm7535F7CXE4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm7535F7CXE4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm7535F7CXE4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm7535F7CXE4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm7535F7CXE4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm7535F7CXE4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.7 ms