Protein–RNA interactions for Protein: F6YH22

Gm5218, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5218F6YH22 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm5218F6YH22 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm5218F6YH22 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm5218F6YH22 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm5218F6YH22 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm5218F6YH22 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm5218F6YH22 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm5218F6YH22 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm5218F6YH22 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm5218F6YH22 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm5218F6YH22 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm5218F6YH22 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm5218F6YH22 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm5218F6YH22 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm5218F6YH22 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm5218F6YH22 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm5218F6YH22 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm5218F6YH22 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm5218F6YH22 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm5218F6YH22 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm5218F6YH22 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm5218F6YH22 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm5218F6YH22 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm5218F6YH22 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm5218F6YH22 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm5218F6YH22 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm5218F6YH22 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm5218F6YH22 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm5218F6YH22 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm5218F6YH22 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm5218F6YH22 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm5218F6YH22 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm5218F6YH22 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm5218F6YH22 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm5218F6YH22 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm5218F6YH22 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm5218F6YH22 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm5218F6YH22 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm5218F6YH22 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm5218F6YH22 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm5218F6YH22 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm5218F6YH22 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm5218F6YH22 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm5218F6YH22 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm5218F6YH22 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm5218F6YH22 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm5218F6YH22 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm5218F6YH22 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm5218F6YH22 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm5218F6YH22 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm5218F6YH22 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm5218F6YH22 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm5218F6YH22 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm5218F6YH22 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm5218F6YH22 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm5218F6YH22 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm5218F6YH22 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm5218F6YH22 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm5218F6YH22 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm5218F6YH22 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm5218F6YH22 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm5218F6YH22 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm5218F6YH22 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm5218F6YH22 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm5218F6YH22 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm5218F6YH22 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm5218F6YH22 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm5218F6YH22 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm5218F6YH22 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm5218F6YH22 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm5218F6YH22 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm5218F6YH22 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm5218F6YH22 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm5218F6YH22 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm5218F6YH22 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm5218F6YH22 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm5218F6YH22 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm5218F6YH22 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm5218F6YH22 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm5218F6YH22 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm5218F6YH22 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm5218F6YH22 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm5218F6YH22 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm5218F6YH22 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm5218F6YH22 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm5218F6YH22 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm5218F6YH22 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm5218F6YH22 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm5218F6YH22 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm5218F6YH22 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm5218F6YH22 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm5218F6YH22 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm5218F6YH22 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm5218F6YH22 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm5218F6YH22 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm5218F6YH22 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm5218F6YH22 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm5218F6YH22 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm5218F6YH22 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm5218F6YH22 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms