Protein–RNA interactions for Protein: F6UCX4

Sptbn5, Spectrin beta, non-erythrocytic 5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn5F6UCX4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Sptbn5F6UCX4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Sptbn5F6UCX4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Sptbn5F6UCX4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Sptbn5F6UCX4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Sptbn5F6UCX4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Sptbn5F6UCX4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Sptbn5F6UCX4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Sptbn5F6UCX4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Sptbn5F6UCX4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Sptbn5F6UCX4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Sptbn5F6UCX4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Sptbn5F6UCX4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Sptbn5F6UCX4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Sptbn5F6UCX4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Sptbn5F6UCX4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Sptbn5F6UCX4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Sptbn5F6UCX4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Sptbn5F6UCX4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Sptbn5F6UCX4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Sptbn5F6UCX4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Sptbn5F6UCX4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Sptbn5F6UCX4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Sptbn5F6UCX4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Sptbn5F6UCX4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Sptbn5F6UCX4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Sptbn5F6UCX4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Sptbn5F6UCX4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Sptbn5F6UCX4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Sptbn5F6UCX4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Sptbn5F6UCX4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Sptbn5F6UCX4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Sptbn5F6UCX4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Sptbn5F6UCX4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Sptbn5F6UCX4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Sptbn5F6UCX4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Sptbn5F6UCX4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Sptbn5F6UCX4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Sptbn5F6UCX4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Sptbn5F6UCX4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Sptbn5F6UCX4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Sptbn5F6UCX4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Sptbn5F6UCX4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Sptbn5F6UCX4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Sptbn5F6UCX4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Sptbn5F6UCX4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Sptbn5F6UCX4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Sptbn5F6UCX4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Sptbn5F6UCX4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Sptbn5F6UCX4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Sptbn5F6UCX4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Sptbn5F6UCX4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Sptbn5F6UCX4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Sptbn5F6UCX4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Sptbn5F6UCX4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Sptbn5F6UCX4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Sptbn5F6UCX4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Sptbn5F6UCX4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Sptbn5F6UCX4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Sptbn5F6UCX4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Sptbn5F6UCX4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Sptbn5F6UCX4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Sptbn5F6UCX4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Sptbn5F6UCX4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Sptbn5F6UCX4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Sptbn5F6UCX4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Sptbn5F6UCX4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Sptbn5F6UCX4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Sptbn5F6UCX4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Sptbn5F6UCX4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Sptbn5F6UCX4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Sptbn5F6UCX4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Sptbn5F6UCX4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Sptbn5F6UCX4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Sptbn5F6UCX4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Sptbn5F6UCX4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Sptbn5F6UCX4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Sptbn5F6UCX4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Sptbn5F6UCX4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Sptbn5F6UCX4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Sptbn5F6UCX4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Sptbn5F6UCX4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Sptbn5F6UCX4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Sptbn5F6UCX4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Sptbn5F6UCX4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Sptbn5F6UCX4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Sptbn5F6UCX4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Sptbn5F6UCX4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Sptbn5F6UCX4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Sptbn5F6UCX4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Sptbn5F6UCX4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Sptbn5F6UCX4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Sptbn5F6UCX4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Sptbn5F6UCX4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Sptbn5F6UCX4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Sptbn5F6UCX4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Sptbn5F6UCX4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Sptbn5F6UCX4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Sptbn5F6UCX4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Sptbn5F6UCX4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms