Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3Y9

2610001J05Rik, RIKEN cDNA 2610001J05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610001J05RikF2Z3Y9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
2610001J05RikF2Z3Y9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
2610001J05RikF2Z3Y9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
2610001J05RikF2Z3Y9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
2610001J05RikF2Z3Y9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
2610001J05RikF2Z3Y9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
2610001J05RikF2Z3Y9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
2610001J05RikF2Z3Y9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
2610001J05RikF2Z3Y9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
2610001J05RikF2Z3Y9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
2610001J05RikF2Z3Y9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
2610001J05RikF2Z3Y9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
2610001J05RikF2Z3Y9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
2610001J05RikF2Z3Y9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
2610001J05RikF2Z3Y9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
2610001J05RikF2Z3Y9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
2610001J05RikF2Z3Y9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
2610001J05RikF2Z3Y9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
2610001J05RikF2Z3Y9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
2610001J05RikF2Z3Y9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
2610001J05RikF2Z3Y9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
2610001J05RikF2Z3Y9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
2610001J05RikF2Z3Y9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms