Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6D7

1700024B05Rik, RIKEN cDNA 1700024B05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700024B05RikE9Q6D7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
1700024B05RikE9Q6D7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
1700024B05RikE9Q6D7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
1700024B05RikE9Q6D7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
1700024B05RikE9Q6D7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
1700024B05RikE9Q6D7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
1700024B05RikE9Q6D7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
1700024B05RikE9Q6D7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
1700024B05RikE9Q6D7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
1700024B05RikE9Q6D7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
1700024B05RikE9Q6D7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
1700024B05RikE9Q6D7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
1700024B05RikE9Q6D7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
1700024B05RikE9Q6D7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
1700024B05RikE9Q6D7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
1700024B05RikE9Q6D7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
1700024B05RikE9Q6D7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
1700024B05RikE9Q6D7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
1700024B05RikE9Q6D7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
1700024B05RikE9Q6D7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
1700024B05RikE9Q6D7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
1700024B05RikE9Q6D7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
1700024B05RikE9Q6D7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
1700024B05RikE9Q6D7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
1700024B05RikE9Q6D7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
1700024B05RikE9Q6D7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
1700024B05RikE9Q6D7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
1700024B05RikE9Q6D7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
1700024B05RikE9Q6D7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
1700024B05RikE9Q6D7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
1700024B05RikE9Q6D7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
1700024B05RikE9Q6D7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
1700024B05RikE9Q6D7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
1700024B05RikE9Q6D7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
1700024B05RikE9Q6D7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
1700024B05RikE9Q6D7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
1700024B05RikE9Q6D7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
1700024B05RikE9Q6D7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
1700024B05RikE9Q6D7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
1700024B05RikE9Q6D7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
1700024B05RikE9Q6D7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
1700024B05RikE9Q6D7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
1700024B05RikE9Q6D7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
1700024B05RikE9Q6D7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
1700024B05RikE9Q6D7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
1700024B05RikE9Q6D7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
1700024B05RikE9Q6D7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
1700024B05RikE9Q6D7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
1700024B05RikE9Q6D7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
1700024B05RikE9Q6D7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
1700024B05RikE9Q6D7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
1700024B05RikE9Q6D7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
1700024B05RikE9Q6D7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
1700024B05RikE9Q6D7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
1700024B05RikE9Q6D7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
1700024B05RikE9Q6D7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
1700024B05RikE9Q6D7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
1700024B05RikE9Q6D7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
1700024B05RikE9Q6D7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
1700024B05RikE9Q6D7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
1700024B05RikE9Q6D7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
1700024B05RikE9Q6D7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
1700024B05RikE9Q6D7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
1700024B05RikE9Q6D7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
1700024B05RikE9Q6D7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
1700024B05RikE9Q6D7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
1700024B05RikE9Q6D7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
1700024B05RikE9Q6D7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
1700024B05RikE9Q6D7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
1700024B05RikE9Q6D7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
1700024B05RikE9Q6D7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
1700024B05RikE9Q6D7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
1700024B05RikE9Q6D7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
1700024B05RikE9Q6D7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
1700024B05RikE9Q6D7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
1700024B05RikE9Q6D7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
1700024B05RikE9Q6D7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
1700024B05RikE9Q6D7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
1700024B05RikE9Q6D7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
1700024B05RikE9Q6D7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
1700024B05RikE9Q6D7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
1700024B05RikE9Q6D7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
1700024B05RikE9Q6D7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
1700024B05RikE9Q6D7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
1700024B05RikE9Q6D7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
1700024B05RikE9Q6D7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
1700024B05RikE9Q6D7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
1700024B05RikE9Q6D7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
1700024B05RikE9Q6D7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
1700024B05RikE9Q6D7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
1700024B05RikE9Q6D7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
1700024B05RikE9Q6D7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
1700024B05RikE9Q6D7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
1700024B05RikE9Q6D7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
1700024B05RikE9Q6D7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
1700024B05RikE9Q6D7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
1700024B05RikE9Q6D7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
1700024B05RikE9Q6D7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
1700024B05RikE9Q6D7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
1700024B05RikE9Q6D7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms