Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC39.99■■■■□ 3.99
BC005561E9Q5E2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC39.97■■■■□ 3.99
BC005561E9Q5E2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.97■■■■□ 3.99
BC005561E9Q5E2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC39.97■■■■□ 3.99
BC005561E9Q5E2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
BC005561E9Q5E2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
BC005561E9Q5E2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.95■■■■□ 3.99
BC005561E9Q5E2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC39.95■■■■□ 3.99
BC005561E9Q5E2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
BC005561E9Q5E2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC39.93■■■■□ 3.98
BC005561E9Q5E2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
BC005561E9Q5E2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
BC005561E9Q5E2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
BC005561E9Q5E2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC39.92■■■■□ 3.98
BC005561E9Q5E2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
BC005561E9Q5E2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
BC005561E9Q5E2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
BC005561E9Q5E2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
BC005561E9Q5E2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC39.9■■■■□ 3.98
BC005561E9Q5E2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
BC005561E9Q5E2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
BC005561E9Q5E2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.98
BC005561E9Q5E2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
BC005561E9Q5E2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
BC005561E9Q5E2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC39.85■■■■□ 3.97
BC005561E9Q5E2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
BC005561E9Q5E2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
BC005561E9Q5E2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
BC005561E9Q5E2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
BC005561E9Q5E2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
BC005561E9Q5E2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
BC005561E9Q5E2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
BC005561E9Q5E2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
BC005561E9Q5E2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
BC005561E9Q5E2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
BC005561E9Q5E2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
BC005561E9Q5E2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
BC005561E9Q5E2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
BC005561E9Q5E2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
BC005561E9Q5E2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.7■■■■□ 3.95
BC005561E9Q5E2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
BC005561E9Q5E2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
BC005561E9Q5E2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
BC005561E9Q5E2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.64■■■■□ 3.94
BC005561E9Q5E2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC39.64■■■■□ 3.94
BC005561E9Q5E2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
BC005561E9Q5E2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
BC005561E9Q5E2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.94
BC005561E9Q5E2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC39.63■■■■□ 3.94
BC005561E9Q5E2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
BC005561E9Q5E2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
BC005561E9Q5E2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC39.63■■■■□ 3.93
BC005561E9Q5E2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
BC005561E9Q5E2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
BC005561E9Q5E2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC39.61■■■■□ 3.93
BC005561E9Q5E2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC39.61■■■■□ 3.93
BC005561E9Q5E2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.6■■■■□ 3.93
BC005561E9Q5E2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC39.59■■■■□ 3.93
BC005561E9Q5E2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
BC005561E9Q5E2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
BC005561E9Q5E2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
BC005561E9Q5E2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.56■■■■□ 3.92
BC005561E9Q5E2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
BC005561E9Q5E2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
BC005561E9Q5E2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
BC005561E9Q5E2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
BC005561E9Q5E2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC39.5■■■■□ 3.91
BC005561E9Q5E2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
BC005561E9Q5E2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
BC005561E9Q5E2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
BC005561E9Q5E2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC39.48■■■■□ 3.91
BC005561E9Q5E2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC39.46■■■■□ 3.91
BC005561E9Q5E2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC39.45■■■■□ 3.91
BC005561E9Q5E2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
BC005561E9Q5E2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
BC005561E9Q5E2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC39.42■■■■□ 3.9
BC005561E9Q5E2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
BC005561E9Q5E2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC39.41■■■■□ 3.9
BC005561E9Q5E2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
BC005561E9Q5E2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
BC005561E9Q5E2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC39.39■■■■□ 3.9
BC005561E9Q5E2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC39.39■■■■□ 3.9
BC005561E9Q5E2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
BC005561E9Q5E2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
BC005561E9Q5E2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
BC005561E9Q5E2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC39.27■■■■□ 3.88
BC005561E9Q5E2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC39.26■■■■□ 3.88
BC005561E9Q5E2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
BC005561E9Q5E2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC39.25■■■■□ 3.87
BC005561E9Q5E2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
BC005561E9Q5E2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
BC005561E9Q5E2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
BC005561E9Q5E2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
BC005561E9Q5E2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
BC005561E9Q5E2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
BC005561E9Q5E2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
BC005561E9Q5E2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC39.21■■■■□ 3.87
BC005561E9Q5E2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
BC005561E9Q5E2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
BC005561E9Q5E2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms