Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Susd1E9Q3H4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Susd1E9Q3H4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Susd1E9Q3H4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Susd1E9Q3H4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Susd1E9Q3H4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Susd1E9Q3H4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Susd1E9Q3H4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Susd1E9Q3H4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Susd1E9Q3H4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Susd1E9Q3H4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Susd1E9Q3H4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Susd1E9Q3H4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Susd1E9Q3H4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Susd1E9Q3H4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Susd1E9Q3H4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Susd1E9Q3H4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Susd1E9Q3H4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Susd1E9Q3H4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Susd1E9Q3H4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Susd1E9Q3H4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Susd1E9Q3H4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Susd1E9Q3H4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Susd1E9Q3H4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Susd1E9Q3H4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Susd1E9Q3H4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Susd1E9Q3H4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Susd1E9Q3H4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Susd1E9Q3H4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Susd1E9Q3H4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Susd1E9Q3H4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Susd1E9Q3H4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Susd1E9Q3H4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Susd1E9Q3H4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Susd1E9Q3H4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Susd1E9Q3H4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Susd1E9Q3H4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Susd1E9Q3H4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Susd1E9Q3H4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Susd1E9Q3H4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Susd1E9Q3H4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Susd1E9Q3H4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Susd1E9Q3H4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Susd1E9Q3H4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Susd1E9Q3H4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Susd1E9Q3H4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Susd1E9Q3H4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Susd1E9Q3H4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Susd1E9Q3H4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Susd1E9Q3H4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Susd1E9Q3H4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Susd1E9Q3H4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Susd1E9Q3H4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Susd1E9Q3H4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Susd1E9Q3H4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Susd1E9Q3H4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Susd1E9Q3H4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Susd1E9Q3H4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Susd1E9Q3H4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Susd1E9Q3H4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Susd1E9Q3H4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Susd1E9Q3H4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Susd1E9Q3H4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Susd1E9Q3H4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Susd1E9Q3H4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Susd1E9Q3H4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Susd1E9Q3H4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Susd1E9Q3H4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Susd1E9Q3H4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Susd1E9Q3H4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Susd1E9Q3H4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Susd1E9Q3H4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Susd1E9Q3H4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Susd1E9Q3H4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Susd1E9Q3H4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Susd1E9Q3H4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Susd1E9Q3H4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Susd1E9Q3H4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Susd1E9Q3H4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Susd1E9Q3H4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Susd1E9Q3H4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Susd1E9Q3H4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Susd1E9Q3H4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Susd1E9Q3H4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Susd1E9Q3H4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Susd1E9Q3H4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Susd1E9Q3H4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Susd1E9Q3H4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Susd1E9Q3H4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Susd1E9Q3H4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Susd1E9Q3H4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Susd1E9Q3H4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Susd1E9Q3H4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Susd1E9Q3H4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Susd1E9Q3H4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Susd1E9Q3H4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Susd1E9Q3H4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Susd1E9Q3H4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Susd1E9Q3H4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Susd1E9Q3H4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms