Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
NebE9Q1W3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
NebE9Q1W3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
NebE9Q1W3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
NebE9Q1W3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
NebE9Q1W3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
NebE9Q1W3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NebE9Q1W3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NebE9Q1W3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NebE9Q1W3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NebE9Q1W3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NebE9Q1W3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NebE9Q1W3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NebE9Q1W3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NebE9Q1W3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NebE9Q1W3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NebE9Q1W3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NebE9Q1W3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
NebE9Q1W3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
NebE9Q1W3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
NebE9Q1W3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
NebE9Q1W3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
NebE9Q1W3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NebE9Q1W3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NebE9Q1W3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
NebE9Q1W3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
NebE9Q1W3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NebE9Q1W3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NebE9Q1W3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NebE9Q1W3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
NebE9Q1W3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NebE9Q1W3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
NebE9Q1W3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
NebE9Q1W3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
NebE9Q1W3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
NebE9Q1W3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
NebE9Q1W3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
NebE9Q1W3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
NebE9Q1W3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
NebE9Q1W3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
NebE9Q1W3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
NebE9Q1W3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
NebE9Q1W3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
NebE9Q1W3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
NebE9Q1W3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
NebE9Q1W3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
NebE9Q1W3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
NebE9Q1W3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
NebE9Q1W3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
NebE9Q1W3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
NebE9Q1W3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
NebE9Q1W3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
NebE9Q1W3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
NebE9Q1W3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
NebE9Q1W3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
NebE9Q1W3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
NebE9Q1W3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
NebE9Q1W3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
NebE9Q1W3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
NebE9Q1W3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
NebE9Q1W3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
NebE9Q1W3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
NebE9Q1W3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
NebE9Q1W3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
NebE9Q1W3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
NebE9Q1W3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
NebE9Q1W3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
NebE9Q1W3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
NebE9Q1W3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
NebE9Q1W3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
NebE9Q1W3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
NebE9Q1W3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
NebE9Q1W3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
NebE9Q1W3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
NebE9Q1W3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
NebE9Q1W3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
NebE9Q1W3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
NebE9Q1W3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
NebE9Q1W3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
NebE9Q1W3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
NebE9Q1W3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
NebE9Q1W3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
NebE9Q1W3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
NebE9Q1W3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
NebE9Q1W3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
NebE9Q1W3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
NebE9Q1W3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
NebE9Q1W3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
NebE9Q1W3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
NebE9Q1W3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
NebE9Q1W3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
NebE9Q1W3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
NebE9Q1W3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
NebE9Q1W3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
NebE9Q1W3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
NebE9Q1W3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
NebE9Q1W3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
NebE9Q1W3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
NebE9Q1W3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
NebE9Q1W3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms