Protein–RNA interactions for Protein: E9PYK3

Parp4, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp4E9PYK3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Parp4E9PYK3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Parp4E9PYK3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Parp4E9PYK3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Parp4E9PYK3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Parp4E9PYK3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Parp4E9PYK3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Parp4E9PYK3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Parp4E9PYK3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Parp4E9PYK3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Parp4E9PYK3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Parp4E9PYK3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Parp4E9PYK3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Parp4E9PYK3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Parp4E9PYK3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Parp4E9PYK3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Parp4E9PYK3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Parp4E9PYK3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Parp4E9PYK3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Parp4E9PYK3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Parp4E9PYK3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Parp4E9PYK3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Parp4E9PYK3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Parp4E9PYK3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Parp4E9PYK3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Parp4E9PYK3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Parp4E9PYK3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Parp4E9PYK3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Parp4E9PYK3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Parp4E9PYK3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Parp4E9PYK3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Parp4E9PYK3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Parp4E9PYK3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Parp4E9PYK3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Parp4E9PYK3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Parp4E9PYK3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Parp4E9PYK3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Parp4E9PYK3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Parp4E9PYK3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Parp4E9PYK3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Parp4E9PYK3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Parp4E9PYK3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Parp4E9PYK3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Parp4E9PYK3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Parp4E9PYK3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Parp4E9PYK3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Parp4E9PYK3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Parp4E9PYK3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Parp4E9PYK3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Parp4E9PYK3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Parp4E9PYK3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Parp4E9PYK3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Parp4E9PYK3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Parp4E9PYK3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Parp4E9PYK3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Parp4E9PYK3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Parp4E9PYK3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Parp4E9PYK3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Parp4E9PYK3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Parp4E9PYK3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Parp4E9PYK3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Parp4E9PYK3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Parp4E9PYK3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Parp4E9PYK3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Parp4E9PYK3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Parp4E9PYK3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Parp4E9PYK3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Parp4E9PYK3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Parp4E9PYK3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Parp4E9PYK3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Parp4E9PYK3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Parp4E9PYK3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Parp4E9PYK3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Parp4E9PYK3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Parp4E9PYK3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Parp4E9PYK3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Parp4E9PYK3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Parp4E9PYK3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Parp4E9PYK3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Parp4E9PYK3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Parp4E9PYK3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Parp4E9PYK3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Parp4E9PYK3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Parp4E9PYK3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Parp4E9PYK3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Parp4E9PYK3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Parp4E9PYK3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Parp4E9PYK3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Parp4E9PYK3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Parp4E9PYK3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Parp4E9PYK3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Parp4E9PYK3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Parp4E9PYK3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Parp4E9PYK3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Parp4E9PYK3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Parp4E9PYK3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Parp4E9PYK3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Parp4E9PYK3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Parp4E9PYK3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Parp4E9PYK3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms