Protein–RNA interactions for Protein: E9PWZ3

Rpl3l, Ribosomal protein L3-like, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3lE9PWZ3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rpl3lE9PWZ3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rpl3lE9PWZ3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rpl3lE9PWZ3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpl3lE9PWZ3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rpl3lE9PWZ3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpl3lE9PWZ3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpl3lE9PWZ3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rpl3lE9PWZ3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpl3lE9PWZ3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rpl3lE9PWZ3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpl3lE9PWZ3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpl3lE9PWZ3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpl3lE9PWZ3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rpl3lE9PWZ3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpl3lE9PWZ3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpl3lE9PWZ3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rpl3lE9PWZ3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpl3lE9PWZ3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpl3lE9PWZ3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpl3lE9PWZ3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpl3lE9PWZ3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpl3lE9PWZ3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpl3lE9PWZ3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rpl3lE9PWZ3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpl3lE9PWZ3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpl3lE9PWZ3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpl3lE9PWZ3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpl3lE9PWZ3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpl3lE9PWZ3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpl3lE9PWZ3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpl3lE9PWZ3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpl3lE9PWZ3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpl3lE9PWZ3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpl3lE9PWZ3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpl3lE9PWZ3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpl3lE9PWZ3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpl3lE9PWZ3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpl3lE9PWZ3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpl3lE9PWZ3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpl3lE9PWZ3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpl3lE9PWZ3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpl3lE9PWZ3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpl3lE9PWZ3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpl3lE9PWZ3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpl3lE9PWZ3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpl3lE9PWZ3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpl3lE9PWZ3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpl3lE9PWZ3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpl3lE9PWZ3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpl3lE9PWZ3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpl3lE9PWZ3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpl3lE9PWZ3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpl3lE9PWZ3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpl3lE9PWZ3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpl3lE9PWZ3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpl3lE9PWZ3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpl3lE9PWZ3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpl3lE9PWZ3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpl3lE9PWZ3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpl3lE9PWZ3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpl3lE9PWZ3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpl3lE9PWZ3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpl3lE9PWZ3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpl3lE9PWZ3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpl3lE9PWZ3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpl3lE9PWZ3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpl3lE9PWZ3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpl3lE9PWZ3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpl3lE9PWZ3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpl3lE9PWZ3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpl3lE9PWZ3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpl3lE9PWZ3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpl3lE9PWZ3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpl3lE9PWZ3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpl3lE9PWZ3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpl3lE9PWZ3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpl3lE9PWZ3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpl3lE9PWZ3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpl3lE9PWZ3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpl3lE9PWZ3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpl3lE9PWZ3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpl3lE9PWZ3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpl3lE9PWZ3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpl3lE9PWZ3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpl3lE9PWZ3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpl3lE9PWZ3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpl3lE9PWZ3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpl3lE9PWZ3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpl3lE9PWZ3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpl3lE9PWZ3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpl3lE9PWZ3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rpl3lE9PWZ3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Rpl3lE9PWZ3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpl3lE9PWZ3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Rpl3lE9PWZ3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpl3lE9PWZ3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpl3lE9PWZ3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpl3lE9PWZ3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpl3lE9PWZ3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.8 ms