Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rdh8D3Z6W3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rdh8D3Z6W3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rdh8D3Z6W3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rdh8D3Z6W3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rdh8D3Z6W3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rdh8D3Z6W3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rdh8D3Z6W3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rdh8D3Z6W3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rdh8D3Z6W3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rdh8D3Z6W3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rdh8D3Z6W3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rdh8D3Z6W3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rdh8D3Z6W3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rdh8D3Z6W3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rdh8D3Z6W3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rdh8D3Z6W3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rdh8D3Z6W3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rdh8D3Z6W3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rdh8D3Z6W3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rdh8D3Z6W3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rdh8D3Z6W3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rdh8D3Z6W3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rdh8D3Z6W3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rdh8D3Z6W3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rdh8D3Z6W3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rdh8D3Z6W3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rdh8D3Z6W3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rdh8D3Z6W3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rdh8D3Z6W3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rdh8D3Z6W3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rdh8D3Z6W3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rdh8D3Z6W3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rdh8D3Z6W3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rdh8D3Z6W3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rdh8D3Z6W3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rdh8D3Z6W3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rdh8D3Z6W3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rdh8D3Z6W3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rdh8D3Z6W3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rdh8D3Z6W3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rdh8D3Z6W3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rdh8D3Z6W3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rdh8D3Z6W3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rdh8D3Z6W3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rdh8D3Z6W3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rdh8D3Z6W3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rdh8D3Z6W3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rdh8D3Z6W3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rdh8D3Z6W3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rdh8D3Z6W3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rdh8D3Z6W3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rdh8D3Z6W3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rdh8D3Z6W3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rdh8D3Z6W3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rdh8D3Z6W3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rdh8D3Z6W3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rdh8D3Z6W3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rdh8D3Z6W3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rdh8D3Z6W3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rdh8D3Z6W3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rdh8D3Z6W3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rdh8D3Z6W3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rdh8D3Z6W3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rdh8D3Z6W3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rdh8D3Z6W3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rdh8D3Z6W3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rdh8D3Z6W3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rdh8D3Z6W3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rdh8D3Z6W3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rdh8D3Z6W3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rdh8D3Z6W3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rdh8D3Z6W3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rdh8D3Z6W3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rdh8D3Z6W3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rdh8D3Z6W3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rdh8D3Z6W3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rdh8D3Z6W3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rdh8D3Z6W3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rdh8D3Z6W3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rdh8D3Z6W3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rdh8D3Z6W3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rdh8D3Z6W3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rdh8D3Z6W3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rdh8D3Z6W3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rdh8D3Z6W3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rdh8D3Z6W3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rdh8D3Z6W3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rdh8D3Z6W3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rdh8D3Z6W3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rdh8D3Z6W3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rdh8D3Z6W3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rdh8D3Z6W3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rdh8D3Z6W3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rdh8D3Z6W3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rdh8D3Z6W3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rdh8D3Z6W3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rdh8D3Z6W3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rdh8D3Z6W3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rdh8D3Z6W3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms