Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5S8

Fam46a, Family with sequence similarity 46, member A, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam46aD3Z5S8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam46aD3Z5S8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam46aD3Z5S8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam46aD3Z5S8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam46aD3Z5S8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam46aD3Z5S8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam46aD3Z5S8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam46aD3Z5S8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam46aD3Z5S8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam46aD3Z5S8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam46aD3Z5S8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam46aD3Z5S8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam46aD3Z5S8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam46aD3Z5S8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam46aD3Z5S8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam46aD3Z5S8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fam46aD3Z5S8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fam46aD3Z5S8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam46aD3Z5S8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam46aD3Z5S8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam46aD3Z5S8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam46aD3Z5S8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam46aD3Z5S8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam46aD3Z5S8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam46aD3Z5S8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam46aD3Z5S8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam46aD3Z5S8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam46aD3Z5S8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam46aD3Z5S8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam46aD3Z5S8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam46aD3Z5S8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fam46aD3Z5S8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam46aD3Z5S8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam46aD3Z5S8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam46aD3Z5S8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam46aD3Z5S8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam46aD3Z5S8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam46aD3Z5S8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam46aD3Z5S8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam46aD3Z5S8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam46aD3Z5S8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam46aD3Z5S8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam46aD3Z5S8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam46aD3Z5S8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fam46aD3Z5S8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam46aD3Z5S8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam46aD3Z5S8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam46aD3Z5S8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fam46aD3Z5S8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam46aD3Z5S8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam46aD3Z5S8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam46aD3Z5S8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Fam46aD3Z5S8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam46aD3Z5S8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam46aD3Z5S8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam46aD3Z5S8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam46aD3Z5S8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam46aD3Z5S8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam46aD3Z5S8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam46aD3Z5S8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam46aD3Z5S8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam46aD3Z5S8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fam46aD3Z5S8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam46aD3Z5S8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam46aD3Z5S8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam46aD3Z5S8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam46aD3Z5S8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam46aD3Z5S8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam46aD3Z5S8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam46aD3Z5S8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fam46aD3Z5S8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam46aD3Z5S8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam46aD3Z5S8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam46aD3Z5S8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam46aD3Z5S8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam46aD3Z5S8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam46aD3Z5S8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam46aD3Z5S8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam46aD3Z5S8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam46aD3Z5S8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam46aD3Z5S8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam46aD3Z5S8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam46aD3Z5S8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam46aD3Z5S8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fam46aD3Z5S8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fam46aD3Z5S8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fam46aD3Z5S8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fam46aD3Z5S8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam46aD3Z5S8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam46aD3Z5S8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam46aD3Z5S8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam46aD3Z5S8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam46aD3Z5S8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam46aD3Z5S8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fam46aD3Z5S8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam46aD3Z5S8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam46aD3Z5S8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam46aD3Z5S8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam46aD3Z5S8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam46aD3Z5S8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms