Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5L4

5430403G16Rik, RIKEN cDNA 5430403G16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430403G16RikD3Z5L4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
5430403G16RikD3Z5L4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
5430403G16RikD3Z5L4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
5430403G16RikD3Z5L4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
5430403G16RikD3Z5L4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
5430403G16RikD3Z5L4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
5430403G16RikD3Z5L4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
5430403G16RikD3Z5L4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
5430403G16RikD3Z5L4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
5430403G16RikD3Z5L4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
5430403G16RikD3Z5L4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
5430403G16RikD3Z5L4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
5430403G16RikD3Z5L4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
5430403G16RikD3Z5L4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
5430403G16RikD3Z5L4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
5430403G16RikD3Z5L4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
5430403G16RikD3Z5L4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
5430403G16RikD3Z5L4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
5430403G16RikD3Z5L4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
5430403G16RikD3Z5L4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
5430403G16RikD3Z5L4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
5430403G16RikD3Z5L4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
5430403G16RikD3Z5L4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
5430403G16RikD3Z5L4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
5430403G16RikD3Z5L4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
5430403G16RikD3Z5L4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
5430403G16RikD3Z5L4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
5430403G16RikD3Z5L4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
5430403G16RikD3Z5L4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
5430403G16RikD3Z5L4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
5430403G16RikD3Z5L4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
5430403G16RikD3Z5L4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
5430403G16RikD3Z5L4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
5430403G16RikD3Z5L4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
5430403G16RikD3Z5L4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
5430403G16RikD3Z5L4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
5430403G16RikD3Z5L4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
5430403G16RikD3Z5L4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
5430403G16RikD3Z5L4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
5430403G16RikD3Z5L4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
5430403G16RikD3Z5L4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
5430403G16RikD3Z5L4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
5430403G16RikD3Z5L4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
5430403G16RikD3Z5L4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
5430403G16RikD3Z5L4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
5430403G16RikD3Z5L4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
5430403G16RikD3Z5L4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
5430403G16RikD3Z5L4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
5430403G16RikD3Z5L4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
5430403G16RikD3Z5L4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
5430403G16RikD3Z5L4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
5430403G16RikD3Z5L4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
5430403G16RikD3Z5L4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
5430403G16RikD3Z5L4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
5430403G16RikD3Z5L4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
5430403G16RikD3Z5L4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
5430403G16RikD3Z5L4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
5430403G16RikD3Z5L4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
5430403G16RikD3Z5L4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
5430403G16RikD3Z5L4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
5430403G16RikD3Z5L4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
5430403G16RikD3Z5L4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
5430403G16RikD3Z5L4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
5430403G16RikD3Z5L4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
5430403G16RikD3Z5L4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
5430403G16RikD3Z5L4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
5430403G16RikD3Z5L4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
5430403G16RikD3Z5L4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
5430403G16RikD3Z5L4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
5430403G16RikD3Z5L4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
5430403G16RikD3Z5L4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
5430403G16RikD3Z5L4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
5430403G16RikD3Z5L4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
5430403G16RikD3Z5L4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
5430403G16RikD3Z5L4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
5430403G16RikD3Z5L4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
5430403G16RikD3Z5L4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
5430403G16RikD3Z5L4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
5430403G16RikD3Z5L4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
5430403G16RikD3Z5L4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
5430403G16RikD3Z5L4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
5430403G16RikD3Z5L4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
5430403G16RikD3Z5L4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
5430403G16RikD3Z5L4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
5430403G16RikD3Z5L4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
5430403G16RikD3Z5L4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
5430403G16RikD3Z5L4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
5430403G16RikD3Z5L4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
5430403G16RikD3Z5L4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
5430403G16RikD3Z5L4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
5430403G16RikD3Z5L4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
5430403G16RikD3Z5L4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
5430403G16RikD3Z5L4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
5430403G16RikD3Z5L4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
5430403G16RikD3Z5L4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
5430403G16RikD3Z5L4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
5430403G16RikD3Z5L4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
5430403G16RikD3Z5L4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
5430403G16RikD3Z5L4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
5430403G16RikD3Z5L4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms